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狂犬病毒的分类

已有 8116 次阅读 2020-9-1 10:10 |个人分类:狂犬病防治|系统分类:科普集锦| 丽沙病毒, 分类, 遗传谱系, ICTV, 蝙蝠

狂犬病毒的分类（丽沙病毒属的物种）

——大型学术专著《狂犬病（Rabies）》最新版选译

第5章 分子流行病学（Molecular epidemiology）

作者：Susan A. Nadin-Davis

加拿大渥太华：加拿大食品检验署，渥太华Fallowfield实验室。

（Canadian Food Inspection Agency, Ottawa Laboratory- Fallowfield, Ottawa, ON, Canada）

5.4 丽沙病毒的分类（Lyssavirus taxonomy）

5.4.1丽沙病毒属的物种（Lyssavirus species）

如表5.1所示，目前所有的丽沙病毒被划分为16个不同的种，其中狂犬病丽沙病毒 (RABV)被国际病毒分类委员会 (ICTV)）指定为该属的代表种（type species）（另有两种新发现的丽沙病毒分离株的分类地位尚未被ICTV确认）。

表5.1　目前丽沙病毒属包括的物种（英汉对照）

（Species currently assigned to the Lyssavirus genus）

a Reservoir host to be confirmed.储存寄主有待确认。

虽然这种分类在过去得到了血清学、免疫学和流行病学信息的支持，它目前越来越多地基于序列数据。N基因的核苷酸相似值（identity value）80%－82%可作为物种区分的适当分界值（cut-off）。一般来说，同一物种的成员具有82% - 100%的相似值，在82% - 95%范围内的值通常定义了该物种内不同的世系（lineages），一个特定变种的所有成员通常表现出 >95%的同一性。

根据某些成员的遗传、免疫和病理特征将这些物种组织成更高层次的组（group），现在表明该属可以被组织成至少三个不同的遗传谱系（phylogroups）。如图5.1所示，遗传谱系 1由RABV、ABLV、ARAV、BBLV、DUVV、GBLV、IRKV、KHUV和两种EBLV组成，遗传谱系2包括非洲特有病毒LBV、HIBV, 和MOKV，遗传谱系3由IKOV、LLEBV、WCBV代表。然而，随着新的分离株继续被鉴定，已知的丽沙病毒的多样性将会增加，该属的成员结构在未来可能不得不重新修订。