独轮车上的博导分享 http://blog.sciencenet.cn/u/yanjx45 狂犬病、流感、结核病和人类遗传学科普园地。 提供根治 “狂犬病恐惧症” 的灵丹妙药。 奉献在中国彻底消除狂犬病的锦囊妙计。

博文

中国狂犬病病毒变种的历史评估和进化分析

已有 8170 次阅读 2012-6-19 10:30 |个人分类:狂犬病防治|系统分类:论文交流| 中国, 历史, 狂犬病, 评估, 变种

论文题目:

A history estimate and evolutionary analysis of rabies virus variants in China

发表刊物:

Journal of General Virology (2010), 91, 759–764

全文下载网址:

http://jgv.sgmjournals.org/content/91/3/759.full.pdf+html

作者:

Pinggang Ming,1  Jiaxin Yan,1  Simon Rayner,2  Shengli Meng,1  Gelin Xu,1  Qing Tang,3  Jie Wu,1  Jing Luo1 and Xiaoming Yang1

1.      Department of Genetic Engineering, Wuhan Institute of Biological Product, 9 Linjiang Street, Wu Chang District, Wuhan 430060, PR China

2.      Department of Bioinformatics, Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences, 44 Xiaohongshan, Wuhan 430071, PR China

3.      State Key Laboratory for Molecular Virology and Genetic Engineering, National Institute for Viral Disease Control and Prevention, China CDC, 100 Yingxin Street, Xuan Wu District, Beijing 100052, PR China

论文摘要:

为了解中国狂犬病毒的进化动力学,我们收集在过去的40年间来自中国14个省区的55株狂犬病毒样本,并进行了测序。对膜蛋白G的基因序列作了系统比较分析。结果表明,目前在中国流行的狂犬病毒由三个主要类群组成。按贝页斯定理联合方法(Bayesian coalescent methods)进行评估,当前中国流行的狂犬病毒株的最近共同祖先可追溯到1412年(95%置信区间是10061736年)。 估计G基因序列的平均替代率是每年每位点3.961X10-4个碱基替代,与以前报告的狂犬病毒的替代率一致。

To investigate the evolutionary dynamics of rabies virus (RABV) in China, we collected and sequenced 55 isolates sampled from 14 Chinese provinces over the last 40 years and performed a coalescent-based analysis of the G gene. This revealed that the RABV currently circulating in China is composed of three main groups. Bayesian coalescent analysis estimated the date of the most recent common ancestor for the current RABV Chinese strains to be 1412 (with a 95% confidence interval of 1006–1736). The estimated mean substitution rate for the G gene sequences (3.961_10”4 substitutions per site per year) was in accordance with previous reports

for RABV. 



https://blog.sciencenet.cn/blog-347754-583658.html

上一篇:多国合作科研项目:全球犬狂犬病病毒的起源和系统进化研究
下一篇:狂犬病毒的进化动力学彰显中国在亚洲狂犬病传播中的重要性
收藏 IP: 219.140.175.*| 热度|

1 曾庆平

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (8 个评论)

数据加载中...
扫一扫,分享此博文

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-11-20 13:16

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部