后来所称的五塔寺始建于1727年(雍正五年)，本是席力图召的下院。席力图召主持获雍正恩准，在小召以东建起三重院落的喇嘛庙，庙墙上每隔一尺都有盏铁铸莲花灯，1732年(雍正十年)赐名“慈灯寺”。1886年(光绪十二年)主持慈灯寺的活佛圆寂，没有转世灵童，喇嘛们全部回到席力图召。慈灯寺从此荒芜破败，只留下那座造型独特的宝塔。现在的五塔寺为2006年重建，但五塔是清代建筑。

现有的五台寺仍是三重院落，布局类似汉传佛寺。但供奉的均是藏传格鲁派(黄教)的佛和菩萨等。进入山门后，中轴线上三进殿分别为三世佛殿、金刚萨锤殿和大日如来殿。

三世佛殿内供奉的是释迦牟尼佛，东方药师佛，西方阿弥陀佛。在三世佛殿旁两侧钟楼和鼓楼式的侧殿，分别为圣观音殿和二十一度母殿。藏传佛教中，度母是观音菩萨的化身，她能救八种苦难，如狮难、象难、蛇难、水难、牢狱难、贼难、非人难，又称为“救八难度母”。

金刚萨锤殿中是呼和浩特召庙文化展。金刚萨埵在汉语佛学典籍中指的是普贤菩萨同体异名的圣尊，在藏传佛教中为密教第二祖。金刚萨锤殿两侧分别为西方阿弥陀佛殿和北方不空成就佛(Dhyani Buddha of the North)殿。

大日如来殿正中间供奉大日如来佛，左右分别有绿度母和白度母。大日如来在汉语佛教典籍中为毗卢遮那佛，佛的三身中的法身佛；在藏传佛教中为密宗初祖，最无上崇高的佛，一切佛法的根本。绿度母又称救度速勇母、救八难度母，为二十一度母所有功德的总摄聚集，而二十一度母是绿度母的不同事业所化现的佛母。白度母又称为增寿救度佛母，是观世音菩萨的化身。有说在藏史中，唐朝的文成公主是绿度母的化身，尼泊尔的赤尊公主是白度母的化身。大日如来殿两侧分别有南方宝生佛(Ratnaketu of the South)殿和东方阿閦佛(Aksobhya of the East)殿。宝生佛汉语佛教典籍中称为“宝幢佛”或“宝相佛”，不常出现。在密教里，宝生佛象征大日如来的平等性智，是重要膜拜对象。阿閦，是梵文Aksobhya的音译，意为不动，代表菩提心坚定不动。因此，阿閦佛又被称为“无怒佛”、“无嗔恚佛”。

中轴线到底就是被称为五塔的金刚座舍利宝塔，由塔基、金刚座和5个舍利宝塔组成。金刚宝座上的五座小塔，代表着密宗金刚界的五位佛主。中央七级浮屠代表大日如来佛。金刚座四角的四座小塔各有五级浮屠，分别为东方不动佛，南方宝生佛，西方阿弥陀佛，北方不空成就佛。二进三进的佛殿就是依次布置。传说中央宝塔中供奉有佛祖舍利，因此被称为“舍利宝塔”。

在金刚座舍利宝塔后墙北有一堵砖砌的墙壁，据说上面自西向东有三幅石刻 “六道轮回图”、“须弥山分布图”和“蒙文天象图”。可惜连同宝塔都被木栅栏封闭，不对游人开放。无缘得见的“蒙文天象图”，是用蒙文标注和刻制的一幅天体星宿图，上面刻有1550多颗星星的位置，星星的名称都用蒙文标出，刻有太阳运行的轨道和二十八宿星座，在天象图的左下方刻有“钦天监绘制天文图”。是现存惟一用少数民族文字标写的天文图。

在庙门入口处，还有喇嘛塔。喇嘛已去留旧塔，砖墙被封隐古图。

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