新冠病毒相关冠状病毒在东南亚蝙蝠和穿山甲中传播的证据

《自然（Nature）》杂志子刊《自然·通讯（Nat Commun）》于2月9日发表了新加坡著名病毒学家王林发联合泰国、澳大利亚、美国和中国的相关病毒学研究人员共同撰写的研究论文：《SARS-CoV-2相关冠状病毒在东南亚蝙蝠和穿山甲中传播的证据（Evidence for SARS-CoV-2 related coronaviruses circulating in bats and pangolins in Southeast Asia）》（见参考文献）。该文以新的雄辩的事实证明，新冠病毒（SARS-CoV-2）起源的最大可能是来源于自然界的蝙蝠。不应当将新冠病毒的传播归咎于某个国家或某个实验室，这些谬论反映了对基本科学事实的藐视。

COVID-19（新冠肺炎）大流行的许多未解问题包括在中国发现的蝙蝠冠状病毒RaTG13的起源，以及中间动物宿主在早期从动物向人类传播中的潜在作用。在中国发现的蝙蝠冠状病毒RaTG13提示新冠病毒蝙蝠来源的可能性很高。

该论文报道了SARS-CoV-2相关冠状病毒(SC2r-CoVs)在东南亚蝙蝠中活跃传播的分子和血清学证据。从泰国的一个洞穴中5只独立的蝙蝠(大角菊头蝠 Rhinolophus acuminatus)中获得了相关病毒的全基因组序列，并获得了一个单独的冠状病毒分离株RacCS203，该分离株与在中国云南马来亚菊头蝠（Rhinolophus malayanus）中发现的RmYN02分离株的亲缘关系最密切。

在同一种群的蝙蝠和泰国南部野生动物检查站的穿山甲中也发现了SARS-CoV-2中和抗体。针对RmYN02受体结合域(RBD)的抗血清能够交叉中和SARS-CoV-2，尽管RacCS203或RmYN02的RBD不能与ACE2（血管紧张素转化酶2，细胞受体）结合。

尽管病毒的起源尚不清楚，但该项研究将遗传多样性SARS-CoV-2相关冠状病毒(SC2r-CoVs)的地理分布范围从日本和中国扩展到泰国，范围超过4,800公里。

迫切需要各国协作进行跨境监测，以发现SARS-CoV-2的直接来源病毒。

本文所用冠状病毒（CoV）的简称（代号）与来源：

SC2r-CoVs： SARS-CoV-2相关冠状病毒。

RaTG13： 2013年，中国云南，菊头蝠。

RmYN02： 2019年5月至10月，中国云南，马来亚菊头蝠（Rhinolophus malayanus）。

RacCS203，2020年6月，泰国，大角菊头蝠（Rhinolophus acuminatus）。

早就应该停止将新冠病毒（SARS-CoV-2）的传播归咎于某个国家或某个实验室。这些谬论反映了对科学事实的藐视，包括最近在泰国蝙蝠身上发现了密切相关的冠状病毒。2013年在中国云南省采样的蝙蝠冠状病毒RatG13与SARS-CoV-2的全基因组同源性为96%，表明大流行冠状病毒可能来自蝙蝠。为确定高度相关病毒的其他可能来源，于2020年6月在泰国东部对300只蝙蝠进行了采样，这些蝙蝠都属于大角菊头蝠（Rhinolophus acuminatus）。100份蝙蝠直肠拭子样本中13份PCR阳性，与SARS-CoV-2和蝙蝠 CoV-RaTG13序列同源性分别为95.86%和96.21%。这种名为RacCS203的病毒似乎是在这个蝙蝠群体中传播的占支配地位的冠状病毒。系统发生分析表明，RacCS203是SARS-CoV-2相关冠状病毒谱系(SC2r-CoV)的新成员。

剌突（spike）受体结合结构域(RBD)的系统发生分析以及与纯化重组蛋白的结合研究表明，RacCS203并不能结合ACE2以进入细胞。以RacCS203为spike基因的伪型VSV（Vesicular Stomatitis Virus，水疱性口炎病毒）不能感染Vero E6细胞，而以SARS-CoV-2为spike基因的伪型VSV病毒能感染Vero E6细胞，证实了这一结论。

采用代理病毒（surrogate virus）中和试验测定蝙蝠血清中阻断SARS-CoV-2受体结合域(RBD)与重组ACE2结合的抗体。在98份蝙蝠血清中，有4份含有阻止这种配体-受体（ ligand-receptor）相互作用的抗体。10份穿山甲血清中有一份含有这种抗体，可阻断SARS-CoV-2的 RBD与ACE2相互作用。这些穿山甲是从泰国中部和南部的非法商人那里没收的，来源不明。

RacCS203的刺突蛋白与蝙蝠分离物RmYN02的刺突蛋白最相似。两者都有部分furin（成对碱性氨基酸蛋白酶，又称弗林蛋白酶）裂解位点，RBD仅在两个氨基酸上有所不同。COVID-19（新冠肺炎）患者血清对SARS-CoV-2和RaTG13的RBD反应强烈，对RmYN02反应弱。兔抗RmYN02和RaTG13的RBD抗体能中和SARS-CoV-2。

这些发现进一步证明了SC2r-CoVs（SARS-CoV-2相关冠状病毒）并不局限于中国。在日本北部、中国东部和西南部以及相距4,800公里的泰国的蝙蝠身上也发现了此类病毒。一旦加强对该地区的监测，可能会在菊头蝠属蝙蝠（Rhinolophus bats）身上发现更多的SC2r-CoVs。这些监测可能会鉴别出SARS-CoV-2的直接祖先，相当于2003年在果子狸中发现的99%相同的SARS-CoV基因组。

参考文献：

Wacharapluesadee, S., Tan, C.W., Maneeorn, P. et al. Evidence for SARS-CoV-2 related coronaviruses circulating in bats and pangolins in Southeast Asia. Nat Commun 12, 972 (2021). https://doi.org/10.1038/s41467-021-21240-1