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Zoonoses 最新文章 等温扩增技术用于COVID-19的诊断:现状与未来展望

已有 2872 次阅读 2022-3-1 10:50 |个人分类:zoonoses|系统分类:科普集锦

Zoonoses 最新文章Isothermal Amplification Technology for Diagnosis of COVID-19: Current Status and Future Prospects

等温扩增技术用于COVID-19的诊断:现状与未来展望

作者:马学军团队,来自中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,国家卫生健康委医学病毒学与病毒疾病重点实验室

新型冠状病毒肺炎(Corona Virus Disease 2019,COVID-19)疾病本传染源主要是新型冠状病毒感染的患者和无症状感染者。潜伏期具有传染性,无症状感染者也可能成为传染源。经呼吸道飞沫和密切接触传播是主要的传播途径。人群普遍易感。感染后或接种新型冠状病毒疫苗后可获得一定的免疫力,有利于控制COVID-19的大流行。

核酸检测(NAT)技术由于其灵敏度高和特异性高的优点,被广泛应用于传染病病原体的早期检测。因此,NAT对于控制传染病的暴发至关重要。在COVID-19大流行期间,聚合酶链反应(PCR)已成为世界范围内检测SARS-CoV-2 RNA的金标准。但是,基于PCR的核酸检测技术仍然存在相对耗时,需要专门的仪器和技术人员等问题,因此,PCR很难应用于初级医疗机构。基于抗体的检测由于抗体出现较晚而存在局限性,因此早期诊断困难,而基于抗原的检测敏感性不足,检测结果假阴性率很高。

2022年1月25日,Zoonoses 在线发表了来自中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,国家卫生健康委医学病毒学与病毒疾病重点实验室的马学军团队最新评论文章《Isothermal Amplification Technology for Diagnosis of COVID-19: Current Status and Future Prospects》。

该研究简要总结了核酸等温扩增技术(IAT)用于检测SARS-CoV-2 RNA检测的四种主要方法的发展和应用,并且详细阐述了不同的IAT在实际应用中的优缺点。

四种主要的IATs有同时扩增和检测(SAT)、重组酶辅助扩增(RAA)、交叉引物放大(CPA)和LAMP离心盘微流控芯片(LAMP-chip),这些已被国家药品监督管理局正式批准用于中国大陆SARS-CoV-2 RNA的检测。

SAT采用全自动核酸提取系统(AutoSAT),可以在8小时内实现对200个样本的高通量检测。然而,AutoSAT并没有克服耗时的问题。此外,SAT仍然需要预先提取样本的常规病毒核酸,因此适合在检疫和检验部门实验室进行高通量的SARS-CoV-2 RNA检测。

实时荧光RAA可用于检测多种样本类型的核酸,如咽拭子、鼻咽拭子、鼻拭子、肺泡灌洗液等,有高灵敏度(200 copies/mL) 和特异性。RAA快速、操作简单、灵活性强,最适合县乡发热诊所和港口检测设施的快速筛查。

实时荧光CPA采用了一体化、全自动的核酸检测系统。CPA扩增产物用分子信标检测,荧光信号由内部荧光检测装置检测到。这种全自动检测管适用于在疫情暴发的早期阶段进行现场筛查。

LAMP-chip 可用于包括新冠病毒在内的6种呼吸道病原体的联合检测,芯片是在63°C下反应1.5h,可同时完成16个样品的扩增,扩增产物用检测仪器进行检测,适用于在医疗机构对有呼吸道疾病指征的患者进行快速分诊。

该研究指出,在实际情况下,联合检测是最优的。IATs可用于初步筛选,PCR可以用于结果的确认和复查 ,充分利用这两种技术,满足港口快速筛查和基层发热诊所快速分诊的实际需求。

表1 等温扩增技术的比较

本篇中文述评来自Zoonoses 青年编委陈雨欣博士

原文链接:

https://www.scienceopen.com/hosted-document?doi=10.15212/ZOONOSES-2021-0022

Zoonoses 是全球第一本有关人兽共患病的金色开源期刊,旨在搭建人兽共患病领域科研人员、临床医生、兽医和公共卫生学者间沟通的桥梁。Zoonoses致力于刊载有关病毒性、细菌性、寄生虫性、真菌性人兽共患病的流行病学、病原学、生物学、诊断、预防、治疗和管理等方面的最新研究。

Zoonoses由中国疾病预防控制中心病毒学首席科学家董小平教授和美国德克萨斯大学医学分部Lynn Soong教授担任共同主编。




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