导读：富集分析结果条目繁多，不同分组的条形不易区分。采用背景色分区，将各分组的条形置于不同色块背景中，这一简单优化即可显著提升视觉清晰度，方便快速对比与解读。

《Nature Genetics》文章Dissecting the impact of transcription factor dose on cell reprogramming heterogeneity using scTF-seq. Fig 5g将不同分组的条形以浅色的矩形背景包裹，展示了3个cluster的GO富集分析结果。图中X轴表示-log10(padj)，Y轴是富集条目，分成三部分：Cluster1低剂量、Cluster2中剂量、Cluster3高剂量的富集结果。垂直线表示显著性阈值padj 0.05。

1，打开作图URL

https://www.bioinformatics.com.cn/plot_basic_go_horizontal_bar_with_labels_247

图2.绘图页面

2，示例数据

点击图片上方的示例数据，下载，并使用excel打开。

图3. 示例数据

示例数据包括4列：

第1列是分组信息，可以是GO的不同类别，或者不同的比较。最多绘制6组

第2列是条目名字

第3列是条目的富集p值（或者padj），在图中以-log10的形式展示，表示bar长度

第4列是条目中与输入基因交集的基因数

注：若没有第4列，可以都写1，然后绘图时，选择不标注第4列即可

3，输入检查

示例数据：点击输入框下面的“示例”按钮，将载入示例数据。

真实数据：数据放在excel中，调整好后，Ctrl+A选中数据，Ctrl+C拷贝，Ctrl+V将数据粘贴到输入框中。

图4. 载入数据，输入检查

然后使用输入框下面的“输入检查”按钮先对输入数据进行检查。若检查不通过，请根据检查提示重复【修改-输入检查】步骤，直到检查通过（如下图所示），然后可以继续选择其他参数。

图5.输入检查结果

注：输入检查是新添加的功能，它会根据不同模块的输入要求，逐行逐列检查输入数据，并给出提示，以确保数据符合模块输入要求。建议每次提交前先进行输入检查。

4，选择参数

图6.绘图参数

图片大小

设置了图片宽度，图片高度参数

文字及字体大小

X轴说明文字：取第3列第一行作为说明，并自动添加-log10()，例如第3列是pvalue，那么图上X轴说明就是-log10(pvalue)

X轴说明字体大小：-log10(pvalue)的字体大小

Y轴条目说明字体大小：Y轴条目的字体大小

标注基因数字体大小：bar右侧标注的第4列的基因数字体大小

分组字体大小：第一列分组信息的字体大小

位置信息

分组信息X轴位置：定义分组信息的位置，负值，越小越靠左

背景左侧X轴位置：背景矩形左侧的位置，负值，越小越靠左

背景右侧X轴位置：背景矩形右侧的位置，正值，越大越靠右

注意：请配合3个位置信息，以完全覆盖分组，条目和bar等信息

颜色

分组的颜色，设置了6种颜色，即最多绘制6组数据

新加功能：解决配色难题

1，颜色集：提供了7种论文的颜色集，点击后，在该论文的颜色集中随机挑选6种颜色

2，随机颜色：点击“随机”按钮后，会随机推荐6种颜色，点击一次，随机一次

3，自定义：可以粘贴空格分隔的16进制颜色编号，例如 #E64B35 #4DBBD5 #00A087

其他

Bar高度：定义了bar的高度，数值越大，bar越粗

背景矩形透明度：背景的透明度，数值越小越透明（颜色越浅）

添加0.05的阈值线：是否需要添加0.05的阈值线（约1.3附近） 

Bar上标注最后一列数字：是否标注第4列的数字

字体

设置了期刊杂志中最常用的两种字体：Times New Roman和Arial。如需使用其他字体，可以下载pdf或者svg图片，然后使用acrobat illustrator或者inkscape进行编辑修改

5，提交出图

检查通过，并且参数选好后，点击“提交”按钮，约2s后，会在页面上显示带背景的分组bar图。我们提供了pdf、svg两种矢量图，png、tiff两种标量图供大家下载使用。

图7.预览图

请使用Acrobat Illustrator，inkscape等软件编辑矢量图（pdf或svg），进行组图，调整文字、图像元素位置，字体，添加说明等操作，以满足个性化需求。

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