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生信入门第十课:Clusterprofiler GO和KEGG富集分析R代码详解 2024-11-19
生信入门合集: 生信入门第一课:VirtualBox安装Ubuntu虚拟机 生信入门第二课:RNA-seq生信分析环境搭 ...
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给热图矩形加个标注--在线绘制带任意文字、符号标注的热图 2024-11-17
导读 : 在聚类热图中,除了颜色编码外,添加文本信息可以提供更精确的数据解释。例如直接在热图的方块内标注p值显著性,从而使得数据的显著性水平一目了然 ...
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在线绘制cancer cell同款双向条形图展示富集结果 2024-11-11
导读: 将上调和下调pathway富集结果以双向条形图的形式在一张图中展示,不仅优化了绘图空间,还通过对称布局增强了图片的美观性。 《 Cancer cell ...
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在线绘制带community的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图 2024-11-11
导读: 分子相互作用网络图揭示了细胞内部分子间的复杂相互作用。通过识别网络中密集连接的节点所形成的社区(community),可以揭示它们之间以前未知的 ...
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在线绘制带颜色标注的大脑脑区图 2024-11-07
导读: 大脑是人体最为复杂的器官之一,由多个功能特化的脑区构成。每个脑区承担着特定的生理和认知功能。通过应用定量数据映射技术,将数值以色彩编码的 ...
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生信入门第九课:PCA、相关性、热图和火山图及代码详解 2024-11-05
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使用pathview在线渲染KEGG Pathway Map,给感兴趣的基因、化合物添加颜色 2024-11-03
导读: 通过将用户提供的基因表达定量数据,化合物定量数据映射并渲染到相关的KEGG通路图上,能够帮助我们直观且系统地研究基因、酶、化合物间的关系。 ...
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测序公司给的分析报告中为什么没有Ensembl GTF注释版本? 2024-11-02
导读: 在做RNA- seq等测序分析时,通常会用到Ensembl的GTF基因注释文件,它有不同的版本。我们调研了十几家测序公司的报告,令人惊讶的是,在报告中明 ...
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