导读：谁说韦恩图只能是三个圈？用饼图锁定共有比例，用弧线拆解交集细节——一次视觉革新，让重叠关系“活”起来。

《Nature Medicine》文章4-1BB costimulation ameliorates T cell exhaustion induced by tonic signaling of chimeric antigen receptors. Fig 2F以饼+弧线图的形式展示了3种marker（PD-1、TIM-3、LAG-3）在细胞中的表达情况。中间的饼图展示了同时有3个marker，2个marker，1个marker和0个marker的细胞的占比情况（颜色从黑到灰）；外侧从内到外共有3个轨道，分表表示3个marker，蓝色：PD-1，红色：TIM-3，绿色LAG-3。从圆心向外辐射，有3种marker的扇形对应着3个arc都有（即：蓝+红+绿3层arc），有2种marker的扇形对应着2个arc都有（即：蓝+红，红+绿，蓝+绿的2层arc），有1种marker的扇形对应着1个arc（即：蓝或者红，或者绿的单层arc），有0种marker的扇形没有对应arc。此图是venn图的变体，适用于3-5个条件的交集展示。与传统venn图相比，可以展示都没有的情况，不精确到具体数值，而是从扇形的大小（快速查看哪种共有占比多）和多层弧线的重叠及弧长（快速查看哪类marker在共有交集中占比多）来展示数据集间的交集情况。同时可以进行多个条件下的构成比例比较分析（并列多张图）。

1，打开作图URL

https://www.bioinformatics.com.cn/plot_pie_arc_venn_plot_295

图2.绘图页面

2，示例数据

点击图片上方的示例数据，下载，并使用excel打开。

图3. 示例数据

示例数据包括至少3列：

第1列是具体的细胞（或者基因，代谢物等）

其他列是不同的样品（或者处理条件），对应的数值为0或者1。0表示不属于（没有），1表示属于（有）。例如第3行的cell3对应的A是1，表示cell3有markerA，而没有markerB和markerC。针对表达谱：行是基因，列是样品，表示有没有表达。

注意：除第1行和第1列外，其他单元格必须是0或者1，不能是其他值。

3，输入检查

示例数据：点击输入框下面的“示例”按钮，将载入示例数据。

真实数据：数据放在excel中，调整好后，Ctrl+A选中数据，Ctrl+C拷贝，Ctrl+V将数据粘贴到输入框中。

图4. 载入数据，输入检查

然后使用输入框下面的“输入检查”按钮先对输入数据进行检查。若检查不通过，请根据检查提示重复【修改-输入检查】步骤，直到检查通过（如下图所示），然后可以继续选择其他参数。

图5.输入检查结果.

 注：输入检查是新添加的功能，它会根据不同模块的输入要求，逐行逐列检查输入数据，并给出提示，以确保数据符合模块输入要求。建议每次提交前先进行输入检查。 

4，选择参数

图6.绘图参数

图片大小

设置了图片宽度，图片高度参数，由于带有legend，所以宽度和高度可以不一样

pie颜色

设置了7种颜色，从上到下依次为：都没有的颜色0，有1个（独有）的颜色1，有2个交集的颜色2等。最多可以绘制6个集合 

arc颜色

设置了6种颜色。颜色1对应第2列，颜色2对应第3列，依次类推。最多可以绘制6层arc（6个数据集）

pie相关

pie半径：数值越大，pie越大。

pie边框宽度：pie是否加一个带颜色的边框，设置为0时则不绘制边框

pie边框颜色：边框的颜色

pie图例说明：pie图例的标题说明

arc相关

arc起始半径：在pie半径基础上稍微大点

arc带宽度：弧线的宽度

arc和arc间的间距：两层arc间空白部分的间距

arc图例：arc的图例标题 

字体大小：

设置了图例的标题字体大小和文字字体大小 

字体种类

设置了期刊杂志中最常用的两种字体：Times New Roman和Arial。如需使用其他字体，可以下载pdf或者svg图片，然后使用acrobat illustrator或者inkscape进行编辑修改

5，提交出图

检查通过，并且参数选好后，点击“提交”按钮，约1s后，会在页面上显示pie+arc图。我们提供了pdf、svg两种矢量图，png、tiff两种标量图供大家下载使用。

 图7.预览图

请使用Acrobat Illustrator，inkscape等软件编辑矢量图（pdf或svg），进行组图，调整文字、图像元素位置，字体，添加说明等操作，以满足个性化需求。

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