日本一共有35种蝙蝠，其中个体较大的狐蝠有2种，即分布在鹿儿岛县和冲绳县的琉球狐蝠(Pteropus dasymallus)和小笠原诸岛分布的小笠原狐蝠(Pterpus pselaphon)，琉球狐蝠在我国台湾地区也有亚种分布。

日本1974年发行的自然保护-哺乳动物邮票一套4枚中，其中一枚便为小笠原狐蝠。

小笠原群岛（Ogasawara Islands，也叫Bonin Islands)是日本在太平洋和菲律宾海之间的群岛，位于东京都以南1000余公里，由30多个小岛组成，其中著名的有小笠原岛、父岛、母岛和硫磺岛等，总面积104.41平方公里。小笠原群岛地处亚热带，岛上灌木枞生，亚热带植物丰富，因为与世隔绝，产生了不少特有物种，有“东方加拉帕格斯”之称，除了小笠原狐蝠，还有眼部羽毛呈黑色三角形的黑眼夜莺、在暗处会发出绿色萤光的绿水母、一度被认为已经灭绝的小笠原鹱等等；黑背信天翁、小笠原牡丹、野杜鹃等也很罕见。2012年6月，日本发行了第三组世界遗产系列的第五套小全张，内容为小笠原群岛上的特色物种，其中就有黑眼夜莺、宽吻海豚、小笠原牡丹等物种。

小笠原狐蝠（Bonin Flying Fox，Pterpus pselaphon）是小笠原诸岛唯一的原生哺乳类动物，通体黑色，间或有少量银白或金色的绒毛混杂，体长约25cm，体重约600克，翼展近1米，整体大小略小于马来大狐蝠。因为属于翼手目动物的大蝙蝠亚目，也有人称之为小笠原大蝙蝠。

小笠原狐蝠的行为也是颇为吸引人们关注的热点之一。和其它狐蝠类不同，夏天它们喜欢独自栖息而不是集群行动；冬天它们会形成一个球形聚集在一起以保持体温。此外，小笠原狐蝠也是动物界中少有存在同性恋行为的生物之一。

和其它狐蝠类似，小笠原狐蝠主要以水果和花蜜为食，这也对岛上的农业生产造成了一定破坏，于是果农纷纷架设防护网，小笠原狐蝠被大量捕杀，导致其数量急剧下降。据2003年《自然科学》记载，小笠原狐蝠在小笠原群岛上的数量加起来也仅仅只有200多只，而在2019年一篇相关文献中，最新的数据是仅剩150只左右。这个在 1996 年还是世界自然保护联盟濒危物种红色名录中易危（VU，Vulnerable）级的物种，如今也成为极危级(CR，Critically Endangered)了。此外，岛上还有一种小笠原伏翼蝙蝠（Bonin pipistrelle bat），属于小蝙蝠类的蝙蝠科伏翼属，也于2020年宣布已经灭绝了。