Effectiveness of Oral Fluid in Pathogenic Surveillance of Acute Respiratory Infection

口腔液在急性呼吸道感染病原学监测中的应用

作者：Huang Qi#, Sun Jingyi#, Dong Mei, Wang Jinxiang, Huang Yanfei, Yu Xiali, Dong Jianping, Liu Fangyao, Zou Lin, Xie Hui*, and Huang Fang*

近日，北京市疾病预防控制中心黄芳教授团队在Zoonoses 发表原创性论文，《Effectiveness of Oral Fluid in Pathogenic Surveillance of Acute Respiratory Infection》（口腔液在急性呼吸道感染病原学监测中的应用）。

口腔液（Oral Fluid，OF）作为一种新型生物标本，是唾液腺分泌液和齿龈沟毛细血管渗出物的混合物，既含有感染的病毒，也含有和血液成分相同的IgM、IgG等抗体。因此，一份OF可以同时用于检测病毒核酸和抗体。新冠病毒感染大流行期间，美国、英国、日本等将OF用于新型冠状病毒核酸和抗体检测，但OF在其他常见呼吸道病原体的应用研究较少，国内尚无相关报道。

该研究首次探索OF在北京市急性呼吸道感染病原学监测中的应用，通过采集2020-2022年769例急性呼吸道感染病例咽拭子和配对OF样本，进行流感病毒和呼吸道合胞病毒等22种呼吸道传染病常见病原体核酸检测。咽拭子阳性率为29.26%，OF阳性率为20.81%，两种样本检测结果总符合率为91.55%，kappa为0.78，表明OF与咽拭子检测结果一致性极好。当咽拭子样本病原体Ct值≤30时，OF样本阳性检出率较高。OF与咽拭子样本检出不同呼吸道病原体的一致性有差异（表1），其中，检测乙型流感病毒、呼吸道合胞病毒、腺病毒和肺炎支原体结果一致性极好（kappa分别为0.92，0.89，1.00和1.00）；检测肠道病毒和冠状病毒高度一致（kappa分别为0.61和0.64）；而检测副流感病毒呈中度一致（kappa为0.47），检测鼻病毒一致性较差（kappa为0.40）。

流行病学特征分析显示，OF样本检测的呼吸道病原谱依次为乙型流感病毒(123/160, 76.88%)、鼻病毒(8/160, 5.00%)、冠状病毒(8/160, 5.00%)、副流感病毒(6/160,3.75%)、肺炎支原体 (5/160, 3.12%)、肠道病毒(4/160, 2.50%)、呼吸道合胞病毒(4/160, 2.50%)和腺病毒(2/160, 1.25%)；≤5岁年龄组阳性率最高(2/2, 100%)，其次是15-59岁(151/709，21.30%)和60岁以上(7/53, 13.21%)的年龄组；2020年12月至2021年2月，阳性率较低，2021年12月检出率上升至高峰水平，以乙型流感病毒为主（图1）。这些特征与咽拭子检测的基本一致。

这些研究结果表明，OF作为无创、安全、便捷和高效的生物样本，尤其适用于难采血儿童、行动不便的老年人、医疗资源匮乏地区、大规模核酸检测和大规模流行病学调查，在呼吸道感染病原诊断和监测中具有很大的应用价值。

表1 咽拭子与口腔液样本中不同呼吸道病原体检出情况的比较

图1 2020年12月- 2021年12月北京市不同月份多种呼吸道病原体分布情况

通讯作者信息：

黄芳，教授，博士生导师，主要从事传染病预防控制和实验室检测，现任北京市疾控中心免疫预防所副所长，首批北京市高层次公共卫生技术人才领军人才。近五年作为项目负责人，主持多项科技部传染病重大专项子课题、北京市科委、首都卫生发展科研专项等多项国家级及省部科研项目；作为主持人，获得北京市科学技术进步奖二等奖、中华预防医学会科学技术奖二等奖。以第一作者和通讯作者发表SCI论文、核心期刊论文40余篇，获技术发明专利1项。

谢会，博士，副研究员，主要从事传染病实验室检测和病原微生物研究。作为核心技术骨干，参与多项首都卫生发展科研专项和北京市科委项目，现主要从事呼吸道病原检测及新型冠状病毒抗体检测方法的建立和免疫效果评价。

原文链接：

https://www.scienceopen.com/hosted-document?doi=10.15212/ZOONOSES-2022-0049