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[转载]runBNG -- 一个命令行BioNano基因组分析软件包

已有 2298 次阅读 2019-3-20 07:00 |个人分类:软件|系统分类:科研笔记| BioNano |文章来源:转载

runBNG将BioNano基因组分析工具包装为单个脚本,能够在命令行运行。

workflow.png

runBNG能够完成包括单分子图谱的质控,光学图谱从头装配,不同光学图谱间的比较,超-重叠群和结构变异检测。与现有软件BioNano IrysView和KSU脚本比较,runBNG的主要优点是整个流程运行在单一平台,并且是高度可定制的。
comparison.png

 
下载:https://github.com/appliedbioinformatics/runBNG
语言:Bash、Perl、Python
时间:20170609
参考:runBNG: A software package for BioNano genomic analysis on the command line



https://blog.sciencenet.cn/blog-707141-1168461.html

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