导读：将z-score表达热图与log2FC条形图并列，使表达异质性、聚类特征与差异变化方向和幅度一目了然，并通过两者趋势的一致性实现了对关键基因的视觉双重验证。

图1. 热图+bar组合图

《Clinical, Cosmetic and Investigational Dermatology》文章Identification of a Gene Expression Signature to Predict the Risk of Abdominal Aortic Aneurysm in Psoriasis Patients. Fig 5A使用热图+bar图组合图展示了20个hub基因的表达和差异情况。左侧是表达热图（z-score转换），右侧是基因的log2FC。与常规热图相比，组合图将表达热图与log2FC条形图并列展示，整合了“表达模式”与“变化幅度”两个关键信息维度，使数据呈现更为丰富。在同一个视野下，既可观察基因在样本间的表达异质性和聚类分群特征，又能直观读取其差异变化的方向与程度，有助于快速筛选出高表达且差异显著的核心基因。同时，热图中表达趋势与条形图中log2FC呈现的一致性，可形成视觉上的双重验证，增强结论的可信度。

1，打开作图URL

https://www.bioinformatics.com.cn/plot_basic_heatmap_and_bar_plot_267

图2.绘图页面

2，示例数据

点击图片上方的示例数据，下载，并使用excel打开。

图3. 示例数据

示例数据包括两部分：表达矩阵和log2FC

表达矩阵：第1行是分组信息（仅支持2组）；第2行是样品名，第3+行是表达值

Log2FC：一列数值 

3，输入检查

示例数据：点击输入框下面的“示例”按钮，将载入示例数据。

真实数据：数据放在excel中，调整好后，Ctrl+A选中数据，Ctrl+C拷贝，Ctrl+V将数据粘贴到输入框中。

图4. 载入数据，输入检查

然后使用输入框下面的“输入检查”按钮先对输入数据进行检查。若检查不通过，请根据检查提示重复【修改-输入检查】步骤，直到检查通过（如下图所示），然后可以继续选择其他参数。

图5.输入检查结果

注：输入检查是新添加的功能，它会根据不同模块的输入要求，逐行逐列检查输入数据，并给出提示，以确保数据符合模块输入要求。建议每次提交前先进行输入检查。 

4，选择参数

图6.绘图参数

图片大小：图片宽度，图片高度参数

字体大小：设置了基因名字体大小，样品名字体大小，log2fc数值（刻度）字体大小，log2FC字体大小

说明文字：设置了colorbar图例标题文字，默认z-score；如果未进行z-score转换，请填写其他说明，例如value。Bar的X轴说明文字，默认log2FC，如果bar展示的是其他值，例如beta值，请填写beta value

Bar相关：设置了bar的宽度，也就是整个bar所在矩形的宽度；bar高度即单条bar的高度（粗细），若基因较多，可以减少该值

热图颜色：表达矩阵所对应热图的渐变颜色，设置了低、中、高三种颜色

热图小矩形边框：设置了边框线的粗细，0则不绘制；边框线的颜色

热图上面分组颜色：样品分组矩形的颜色

新加功能：解决配色难题

1，颜色集：提供了7种常见期刊的颜色集，点击后，在该论文的颜色集中随机挑选并填充颜色

2，随机颜色：点击“随机”按钮后，会随机推荐2种颜色并填充，点击一次，随机一次

3，自定义：可以粘贴空格分隔的16进制颜色编号，例如 #E64B35 #4DBBD5，点击“更新”按钮后，自动填充颜色 

bar颜色：设置了上调和下调的颜色 

scale：是否进行z-score转换

行、列是否聚类：选择聚类时会重排顺序，并根据相似性添加聚类树 

聚类方法和距离方法：可以组合选择不同方法以满足“两组分开和指定顺序”的定制需求

热图标注数值：是否给热图的小矩形添加数值，选择scale时，添加的是z-score的值；选择不scale时，添加的是实际的值。建议不scale时进行标注

字体 

设置了期刊杂志中最常用的两种字体：Times New Roman和Arial。如需使用其他字体，可以下载pdf或者svg图片，然后使用acrobat illustrator或者inkscape进行编辑修改 

5，提交出图

检查通过，并且参数选好后，点击“提交”按钮，约2s后，会在页面上展示热图+bar图组合图预览。我们提供了pdf、svg两种矢量图，png、tiff两种标量图供大家下载使用。

图7.预览图

请使用Acrobat Illustrator，inkscape等软件编辑矢量图（pdf或svg），进行组图，调整文字、图像元素位置，字体，添加说明等操作，以满足个性化需求。

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