导读：以彗星图展示三组差异基因的GO富集分析，红色示上调、蓝色示下调，尾部圆圈标注基因数，视觉新颖，信息呈现直观生动。

《Journal of Advanced Research》文章Time-series transcriptome and metabolome profiling Uncovers WRKY6 and WRKY23 as critical regulators in tobacco response to Pseudomonas syringae infection. Fig 2C以新颖的彗星图（Comet Plot）展示了三个条件下差异基因的Gene Ontology富集分析结果。图中，Y轴为GO条目，X轴表示对应的差异基因数目。红色彗星代表上调基因，蓝色代表下调基因，颜色的深浅随基因数目的增减而渐变变化。尤为巧妙的是，每个彗星尾部都嵌有一个圆圈，圆圈内的数字直观标注了该GO条目中的差异基因数量，圆圈边框颜色则与整体渐变色保持一致。相较于传统的火柴杆图等展示方式，彗星图不仅信息呈现更为丰富直观，其独特的视觉设计也令人眼前一亮，极大增强了图表的吸引力与可读性。

1，打开作图URL

https://www.bioinformatics.com.cn/plot_basic_enrichment_comet_plot_292

图2.绘图页面

2，示例数据

点击图片上方的示例数据，下载，并使用excel打开。

图3. 示例数据

示例数据包括4列。

第1列是富集term，例如GO term，KEGG的Description

第2列是分组，例如GO的BP、CC、MF或者不同的比较，用于分面

第3列是基因数

第4列是方向，必须是up或者down。

注：此处没有考虑p值，可以挑选p值显著的绘图

3，输入检查

示例数据：点击输入框下面的“示例”按钮，将载入示例数据。

真实数据：数据放在excel中，调整好后，Ctrl+A选中数据，Ctrl+C拷贝，Ctrl+V将数据粘贴到输入框中。

图4. 载入数据，输入检查

然后使用输入框下面的“输入检查”按钮先对输入数据进行检查。若检查不通过，请根据检查提示重复【修改-输入检查】步骤，直到检查通过（如下图所示），然后可以继续选择其他参数。

图5.输入检查结果

注：输入检查是新添加的功能，它会根据不同模块的输入要求，逐行逐列检查输入数据，并给出提示，以确保数据符合模块输入要求。建议每次提交前线进行输入检查。

4，选择参数

图6.绘图参数

图片大小

包括图片宽度和图片高度，请配合输入数据行数和Y轴字体大小进行调整。

colorbar颜色和名字

提供了down、中间、up三种颜色的渐变。

注：文章中的渐变是双色的，这里使用三色，也就是从中间的0向左右两边渐变，让图片颜色区分更加明显，也更符合逻辑

字体大小

设置了X轴Number of Genes字体大小，Y轴term的字体大小，彗星尾圆圈中基因数的字体大小

X轴范围扩展系数（避免圈被截断）

X轴的数据范围向外扩展的比例，1.05表示在实际数据范围基础上扩展5%，以保证彗星尾的圆圈不被截断 

colorbar的宽度（占图片的比例）

图片顶部colorbar的宽度，这里也是比例，即colorbar的宽度占整个图片的宽度，用于对colorbar的宽度进行微调，以便与主图对齐

字体

设置了期刊杂志中最常用的两种字体：Times New Roman和Arial。如需使用其他字体，可以下载pdf或者svg图片，然后使用acrobat illustrator或者inkscape进行编辑修改

5，提交出图

检查通过，并且参数选好后，点击“提交”按钮，约3s后，会在页面上显示彗星图。我们提供了pdf、svg两种矢量图，png、tiff两种标量图供大家下载使用。

图7.预览图

请使用Acrobat Illustrator，inkscape等软件编辑矢量图（pdf或svg），进行组图，调整文字、图像元素位置，字体，添加说明等操作，以满足个性化需求。

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