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同一群体高密度标记和低密度标记作图效果比较

已有 5353 次阅读 2013-9-25 13:15 |个人分类:QTL精细定位|系统分类:科研笔记

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21390234

Gains in QTL detection using an ultra-high density SNP map based on population sequencing relative to traditional RFLP/SSR markers.

用同样的群体,比较了不同密度的标记建立的遗传图谱在进行QTL作图时的效果.这是篇非常值得珍藏和学习的文章(呵呵,不过我现在只看了下标题).

估计,不久的将来,那些曾今经常用于作图的重组自交系,都会用高通量测序或者芯片等方法获得高密度遗传图谱.这是一个趋势.因为测序能力的飞速发展,成本的显著降低.精度越高越好.

这篇文章可能也值得一看:Microarray-assisted fine-mapping of quantitative trait loci for cold tolerance in rice.
Liu F, Xu W, Song Q, Tan L, Liu J, Zhu Z, Fu Y, Su Z, Sun C. Mol Plant. 2013 May;6(3):757-67. doi: 10.1093/mp/sss161. Epub 2012 Dec 23.

这是比较有前瞻性的研究.十年后,估计用低密度的标记,发文章可能都难了.不得不,感叹这个时代的进步.十年后的定位,精细定位和图位克隆是什么状况呢?可以想象的是:十年后仍有许多水稻功能是未知的.



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