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hLife Collection | Viruses （Part Ⅰ)

已有 1751 次阅读 2026-3-18 15:58 |系统分类:论文交流

1. Single-cell transcriptome analysis reveals mechanism of phosphodiesterase inhibitor in neonatal mouse infection-associated liver injury treatment

hLife | 广妇儿张玉霞/温哲研究团队揭示靶向PDE重塑中性粒细胞发育轨迹可治疗新生儿轮状病毒肝损伤

通信作者：张玉霞，温哲

本文揭示靶向磷酸二酯酶类（Phosphodiesterases，PDEs）抑制剂可调节整体免疫微环境，维持免疫稳态，从而抑制感染引发的异常免疫反应，显著改善新生儿轮状病毒肝损伤，这一成果为临床治疗提供了新靶点。

引用：

Chen X, Xu Y, Ren H, et al. Single-cell transcriptome analysis reveals mechanism of phosphodiesterase inhibitor in neonatal mouse infection associated liver injury treatment. hLife 2025; 3: 538–550.

2. Metagenomic mining reveals novel viral histones in dsDNA viruses

hLife | 浙大刘越/王海波团队通过元基因组挖掘揭示dsDNA病毒中的新型病毒组蛋白

通信作者：王海波、刘越

本研究利用基于结构的蛋白质大规模比对方法，对IMG/VR 4宏基因组数据库进行了系统分析，成功鉴定出超过1500个病毒来源的组蛋白和组蛋白折叠蛋白，显著拓展了病毒组蛋白的结构和功能多样性。

引用：

Liu Y, Hou Z, Hao W, et al. Metagenomic mining reveals novel viral histones in dsDNA viruses. hLife 2025; 3: 284–296.

3. Diversity of reverse-transcriptase-containing viruses through global metagenomics

hLife | 病毒逆转录酶：从进化到功能的深度解析

通信作者：梁彦韬，Andrew McMinn，汪岷

本研究对病毒逆转录酶的系统挖掘和全面分析揭示了它们在进化和功能方面的多样性，有助于推动发展新型遗传工具和药物靶点。该研究加深了我们对环境中病毒-微生物相互作用的理解，以及病毒对人类肠道微生物群落稳态的贡献。

引用：

Zheng K, Liang Y, Zhang Y, et al. Diversity of reverse-transcriptase-containing viruses through global metagenomics. hLife 2024; 3: 52–56.

4. A One Health perspective on the 2025 chikungunya outbreak in Guangdong province, China

hLife | 温州医科大学陆家海研究团队评述广东基孔肯雅热疫情：“同一健康”的启示与新策略

通信作者：陆家海

2025年以来，广东省已报告超1万例基孔肯雅热确诊病例，其中佛山市病例占比最多。此前，虽然基孔肯雅热疫情已得到一定控制，但由于假期人员流动量大，以及台风暴雨恶劣天气的影响，使仍处于蚊媒活跃期的广东存在疫情持续传播的风险。面对这一复杂局面，任何单一部门的干预措施都难以有效应对，亟需采取协调一致的多部门协作方法以解决其传播的多层面问题。本文系统梳理了基孔肯雅热的全球以及广东疫情流行现状及其影响因素，并提出“同一健康”视角下蚊媒传染病的防控策略。

引用：

Guo C, Mishra N, Aouacheria A, et al. A One Health perspective on the 2025 chikungunya outbreak in Guangdong province, China. hLife 2025; 3: 618–620.

5.CHIKVdb: A comprehensive genomic resource for chikungunya virus surveillance and outbreak response

hLife | CHIKVdb：基孔肯雅病毒数据库助力疫情快速监测、识别和溯源

通信作者：马俊才、吴林寰

基孔肯雅病毒（Chikungunya virus, CHIKV）是一种由伊蚊传播的重要虫媒病毒，可引起基孔肯雅热，其特征是严重且往往持续性的关节痛，对全球公共卫生造成重大负担。近年来，CHIKV 的暴发频率和地理范围均有所增加，凸显出加强基因组监测和快速疫情应对的迫切需求。然而，现有的公共CHIKV基因组数据库通常数据分散、注释不完整，且分析流程效率有待提高，限制了其在紧急情况下的应用价值。本研究团队开发了基孔肯雅病毒数据库(CHIKVdb，https://nmdc.cn/gcpathogen/chikv)。该资源整合了来自99个国家、跨越40年的8193条CHIKV核苷酸序列（涵盖五大宿主类型）以及10,637条蛋白质序列，旨在为当前及未来的疫情响应提供支撑。

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引用：

Guo C, Fan G, Chen Q, et al. CHIKVdb: A comprehensive genomic resource for chikungunya virus surveillance and outbreak response. hLife 2025; 3: 647–650.

6. VarEPS-MPXV: A risk evaluation system for observed and virtual variations in mpox virus genomes

hLife | VarEPS-MPXV: 猴痘病毒变异预警系统助力精准防控

通信作者：马俊才、胡松年、吴林寰

VarEPS-MPXV系统的推出，为病毒监测注入了新的视角。通过多维风险评估模型与多源数据动态监测的结合，系统为全球疫情防控提供了科学化、精细化的分析工具。其价值不仅在于对现有变异的深度解析，更在于为未发生突变的虚拟预测提供了技术路径。未来，随着数据的持续积累与方法的迭代优化，这一平台或可进一步深化对病毒演化规律的理解，并为公共卫生决策提供更具前瞻性的支持。系统所构建的开放框架，也为其他新发传染病防控策略的制定提供了潜在参考，体现了科学与技术协同创新的深远意义。

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引用：

Sun Q, Shu C, Liu Y, et al. VarEPS-MPXV: A risk evaluation system for observed and virtual variations in mpox virus genomes. hLife 2025; 3: 327–337.

7. Modeling the pathogenic infection of mpox virus clade IIb in type I and II interferon pathway double deficient mice

hLife | 广州医科大学李锋/唐小平研究团队成功建立猴痘病毒IIb分支I和II型干扰素通路双缺陷小鼠感染致病模型

通信作者：李峰

本研究成功在I和II型干扰素通路双缺陷小鼠上建立MPXV IIb感染致病模型，为深入研究MPXV发病机制和抗MPXV药物体内评估提供一个新的稳定模型。

引用：

Fan Q, Jiang M, Lv T, et al. Modeling the pathogenic infection of mpox virus clade IIb in type I and II interferon pathway double deficient mice. hLife 2025; 3: 297–300.

8. Advancing virology research with a human brain organoid platform

hLife | 人脑类器官：加速病毒学研究领域的新突破

通信作者：谭文杰

本文综述了人脑类器官在病毒学研究领域的进展。此外本文讨论了该模型的局限性，并展望了人脑类器官的未来发展和应用。

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引用：

Liu J, Zhu N, Huo W, et al. Advancing virology research with a human brain organoid platform. hLife 2025; 3: 237–242.

9. Engineering of highly active gene targeting RNase P ribozyme against human cytomegalovirus infection

通信作者：刘奋勇

Highlights

· An active sequence-specific ribozyme is engineered from ribonuclease (RNase) P catalytic RNA with novel mutations enhancing its activity.

· The engineered RNase P ribozyme represents a gene-targeting agent by cleaving a target mRNA and reducing its expression.

· The constructed ribozyme inhibits the major capsid protein expression of human cytomegalovirus and viral growth in cells.

引用：

Liu Y, Yan B, Zhang I, et al. Engineering of highly active gene targeting RNase P ribozyme against human cytomegalovirus infection. hLife 2025; 3: 243–252.