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人偏肺病毒(hMPV)是引起儿童、老年人及免疫功能低下人群严重呼吸道感染的主要病原体之一。尽管自2001年被发现以来,hMPV已在全球广泛流行,但目前临床上仍缺乏获批的疫苗或特异性抗病毒药物。hMPV基因组编码9个蛋白,其中M2-2蛋白被认为在调节病毒转录/复制平衡及免疫逃逸中起关键作用。然而,hMPV如何通过操纵宿主细胞机制来建立有利于自身复制的环境,其分子细节仍有待深入发掘。
近日,中国科学院上海药物研究所张珂研究团队在hLife发表了题为“hMPV M2-2 protein modulates host mRNA alternative splicing to favor virus replication”的研究论文(图1)。

图1 论文标题及作者信息
研究团队通过亲和纯化-质谱(AP-MS)技术,系统鉴定出168个与hMPV蛋白高度相关的宿主互作蛋白,并绘制了hMPV-宿主蛋白相互作用全图谱。hMPV各病毒蛋白在 HEK293T细胞中的亚细胞定位结果显示,不同病毒蛋白具有差异化的细胞定位特征(图2)。

图2 hMPV病毒蛋白在HEK293T细胞中的定位
PPI网络分析显示,hMPV蛋白可与参与mRNA剪接、mRNA翻译、RNA加工以及蛋白质折叠等生物学过程的宿主蛋白发生互作(图3)。

图3 hMPV-宿主蛋白-蛋白相互作用网络
在所有病毒蛋白中,M2-2蛋白与剪接通路的联系尤为紧密,实验证实M2-2与hnRNP H1、hnRNP M及hnRNP U存在相互作用,且原位邻位连接实验(PLA)显示这些互作主要发生在细胞核内(图4F-4K)。

图4 M2-2蛋白与细胞剪接因子hnRNP H1、hnRNP M和hnRNP U相互作用
通过RNA-seq分析发现,M2-2的表达引起了403个基因的表达水平变化,并显著改变了1073个基因的1473个可变剪接事件。研究者通过RT-PCR验证了包括STRAP、TANC2、RECK和NCL在内的多个关键基因在M2-2影响下发生了显著的剪接异构体转换。在真实的hMPV感染模型中,STRAP和TANC2的剪接模式同样发生改变(图5D-5E),而利用shRNA敲低M2-2后,这种异常剪接得到了恢复(图5J-5K)。

图5 hMPV诱导STRAP和TANC2可变剪接促进病毒复制
功能性实验进一步表明,敲除STRAP或TANC2会导致病毒F蛋白表达量显著下降(图5P-5Q),并使病毒滴度分别下降约9倍和33倍(图5R),证实了这些宿主因子对病毒生命周期的重要性。研究还揭示了不同的调控逻辑:STRAP的剪接诱导依赖于M2-2与hnRNP M的互作,而TANC2则受M2-2、hnRNP H1和hnRNP M的共同调控(图6B-6C)。此外,对比其他呼吸道病毒发现,STRAP的剪接改变是hMPV所特有的,而IAV和RSV对TANC2的调控方向与hMPV完全相反(图6E)。

图6 hMPV感染期间M2-2特异性诱导STRAP和TANC2的可变剪接
未来展望与重要意义
本研究揭示了hMPV M2-2蛋白的一种全新功能机制:通过“劫持”宿主剪接机器来重塑宿主转录组,从而为病毒的大规模增殖创造条件。这一发现不仅扩展了对肺炎病毒科蛋白功能的认知,更重要的是,病毒-剪接体界面的发现为开发新型抗hMPV治疗策略提供了极具潜力的药物靶点。
作者简介
郭佳音 博士研究生
第一作者
机构:中国科学院上海药物研究所
研究方向:病毒感染与mRNA可变剪接
黄益曼 博士研究生
第一作者
机构:中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所
研究方向:呼吸道类器官与病毒感染
焦鹏涛 副研究员
第一作者
机构:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
研究方向:人畜共患病原体免疫逃逸
茅缪伟 青年研究员
通信作者
机构:复旦大学附属眼耳鼻喉科医院
研究方向:RNA合成生物学
郑丽舒 研究员
通信作者
机构:中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所
研究方向:抗病毒疫苗和药物
张珂 研究员
通信作者
机构:中国科学院上海药物研究所
研究方向:病毒感染与RNA代谢
引用格式:Guo J, Huang Y, Jiao P, et al. hMPV M2-2 protein modulates host mRNA alternative splicing to favor virus replication. hLife 2026;4:369–388.
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