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细胞通讯或互作是多细胞生物的基本而重要的生命活动,关于其基本概念可以参见生物组织内细胞通讯。随着单细胞测序技术和空间转录组测序技术的发展,许多细胞通讯网络识别方法被开发出来,这些方法各有特色,因此统一识别的框架LIANA应运而(参见生细胞通讯推理框架)。随着细胞通讯研究的不断推荐,相关的数据库也出现了(参见人类细胞互作数据库:CITEdb)。
以往的识别方法主要基于先验配体-受体互作关系数据来识别细胞通讯或互作网络,并且基于的单细胞测序数据样本主要是单一条件(例如疾病)。因此,样本内的细胞都是来自相同的生物条件。真实情况是,单细胞测序数据的样本汪汪来自多种生物条件,每一种生物条件下的细胞通讯或互作网络必定有差异。如何识别不同生物条件下的差异性细胞通讯或互作网络(图1)成为摆在面前的问题。
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http://www.pubmedplus.cn/P/SearchQuickResult?wd=eea40bb2-507a-41ae-b6e0-3d2c0d035709
01. | Animals | 83 篇 | 100.000% |
02. | Signal Transduction | 83 篇 | 100.000% |
03. | Humans | 64 篇 | 77.108% |
04. | Cell Communication | 48 篇 | 57.831% |
05. | Mice | 13 篇 | 15.663% |
06. | Neurons | 11 篇 | 13.253% |
07. | Models, Biological | 10 篇 | 12.048% |
08. | Cell Differentiation | 9 篇 | 10.843% |
09. | Neoplasms | 9 篇 | 10.843% |
10. | Gene Expression Regulation, Developmental | 8 篇 | 9.639% |
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