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差异性细胞通讯或互作网络

已有 832 次阅读 2023-1-8 20:59 |个人分类:信息分析|系统分类:科研笔记


细胞通讯或互作是多细胞生物的基本而重要的生命活动,关于其基本概念可以参见生物组织内细胞通讯。随着单细胞测序技术和空间转录组测序技术的发展,许多细胞通讯网络识别方法被开发出来,这些方法各有特色,因此统一识别的框架LIANA应运而(参见生细胞通讯推理框架)。随着细胞通讯研究的不断推荐,相关的数据库也出现了(参见人类细胞互作数据库:CITEdb)。

 

以往的识别方法主要基于先验配体-受体互作关系数据来识别细胞通讯或互作网络,并且基于的单细胞测序数据样本主要是单一条件(例如疾病)。因此,样本内的细胞都是来自相同的生物条件。真实情况是,单细胞测序数据的样本汪汪来自多种生物条件,每一种生物条件下的细胞通讯或互作网络必定有差异。如何识别不同生物条件下的差异性细胞通讯或互作网络(图1)成为摆在面前的问题。

https://blog.sciencenet.cn/blog-571917-1371141.html

http://www.pubmedplus.cn/P/SearchQuickResult?wd=eea40bb2-507a-41ae-b6e0-3d2c0d035709

01.Animals83 篇100.000%
02.Signal Transduction83 篇100.000%
03.Humans64 篇77.108%
04.Cell Communication48 篇57.831%
05.Mice13 篇15.663%
06.Neurons11 篇13.253%
07.Models, Biological10 篇12.048%
08.Cell Differentiation9 篇10.843%
09.Neoplasms9 篇10.843%
10.Gene Expression Regulation, Developmental8 篇9.639%




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