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狂犬病毒的分类

已有 1476 次阅读 2020-9-1 10:10 |个人分类:狂犬病防治|系统分类:科普集锦| 丽沙病毒, 分类, 遗传谱系, ICTV, 蝙蝠

狂犬病毒的分类(丽沙病毒属的物种

——大型学术专著《狂犬病(Rabies)》最新版选译

 

5章 分子流行病学(Molecular epidemiology)

作者:Susan A. Nadin-Davis

加拿大渥太华:加拿大食品检验署,渥太华Fallowfield实验室。

Canadian Food Inspection Agency, Ottawa Laboratory- Fallowfield, Ottawa, ON, Canada)

5.4 丽沙病毒的分类(Lyssavirus taxonomy

5.4.1丽沙病毒属的物种(Lyssavirus species

如表5.1所示,目前所有的丽沙病毒被划分为16个不同的种,其中狂犬病丽沙病毒 (RABV)国际病毒分类委员会 (ICTV)指定为该属的代表种(type species(另有两种新发现的丽沙病毒分离株的分类地位尚未被ICTV确认)。

 

5.1 目前丽沙病毒属包括的物种(英汉对照)

Species currently assigned to the Lyssavirus genus

 image.png

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image.png

a Reservoir host to be confirmed.储存寄主有待确认。


虽然这种分类在过去得到了血清学、免疫学和流行病学信息的支持,它目前越来越多地基于序列数据。N基因的核苷酸相似值(identity value80%82%可作为物种区分的适当分界值(cut-off)。一般来说,同一物种的成员具有82% - 100%的相似值,在82% - 95%范围内的值通常定义了该物种内不同的世系(lineages),一个特定变种的所有成员通常表现出 >95%的同一性。

根据某些成员的遗传、免疫和病理特征将这些物种组织成更高层次的组(group),现在表明该属可以被组织成至少三个不同的遗传谱系(phylogroups)。如图5.1所示,遗传谱系 1RABVABLVARAVBBLVDUVVGBLVIRKVKHUV和两种EBLV组成,遗传谱系2包括非洲特有病毒LBVHIBV, MOKV遗传谱系3IKOVLLEBVWCBV代表。然而,随着新的分离株继续被鉴定,已知的丽沙病毒的多样性将会增加,该属的成员结构在未来可能不得不重新修订。

然而,对丽沙病毒的这种划分确实具有功能上的意义,因为当前的疫苗对所有的遗传谱系1病毒有效,但对其他遗传谱系的病毒的效果有限甚至是无效的。

参考文献:

唐青 严家新:第六章 狂犬病病毒的分子流行病学和系统进化史,《狂犬病和狂犬病疫苗(俞永新主编,中国医药科技出版社,2009年版)

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