Not for Science!!分享 http://blog.sciencenet.cn/u/mengchanghe

博文

文献讨论7:土壤DNA Barcoding技术用于评估生物多样性

已有 3890 次阅读 2012-5-10 21:22 |个人分类:文献阅读及心得|系统分类:科研笔记| 生物多样性, DNA, barcoding

Yoccoz et al 2012.pdf

   DNA from soil mirrors plant taxonomic and growth form diversity


   如标题所示,随着DNA Barcoding 技术的兴起,其被越来越广泛的应用到生态学领域,如John Kress提出通过对土壤中的根系进行Barcoding,可以估算地下生物多样性。本文试图从土壤中的DNA来进行Barcoding,这种方法只需要少量的样品,但是又不受季节时间的限制,因而可以得到快速高效的应用。其用数据证明在极地地区,测出来的土壤内DNA能较好的反映当下植物功能和结构;在温带地区,测出来的DNA也比较稳定,年代越久,DNA含量越少;在热带地区,也可以应用;同时本文推荐选用较短的序列来比对……


   本文观点还是很新颖的,如能应用也确实能起到快速评估的效果。所以本人一开始是很喜欢这篇文章的,但是显然,本文有很多不足之处:


1. 其三个假设全部都在不同的植被类型下验证的,比如在温带,土壤DNA较为稳定,然而,在热带地区气温高降解快,很有可能结果不一样,而在极地则能保存很久。

2. 本研究中热带地区的研究仅仅用了49个soil core(每个core很小), 这些DNA来自25ha样地内三分之一的种,这显然是不能令人信服的,这种关于种-取样面积曲线都需要测定的。

3. 图2木本植物比例是log之后作图的,但是其他两种是没有进行处理的,这种比例的数据一般不需要log,而且一般需要统一……

4. 图1表述不清楚,是物种数据做的ordination 吗?


   综上,F同学认为本文应该是某个workshop的结果,3个不同地区的人做的,然后合作写的文章,他是要拒掉这篇文章的,假如他是评委的话……副研也拒掉了,因为他前面的全部说接收,所以他丫的怒了,拒了。(接收:7,拒:3)






https://blog.sciencenet.cn/blog-434209-569425.html

上一篇:生态学文献讨论6:作物高产也能保持高生物多样性?
下一篇:生态学文献8:biomass和物种数量的关系
收藏 IP: 210.72.93.*| 热度|

0

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (0 个评论)

数据加载中...
扫一扫,分享此博文

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-5-11 13:59

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部