9月28日，朱清时离开深圳，他在南方科技大学的五年校长任期已满。五年来，他坚持充当中国高等教育改革的“鲶鱼”，冀以引起中国高等教育的“鲶鱼效应”。虽然最终不算目标达成，但五年来的探索，特别是他的三面改革大旗：“去行政化”、“自主招生”、“自授学位”，足以让国人对这位68岁老人充满敬意。五年来，他进行了如下探索：

1、去行政化，实施教授治校。

这面大旗，是朱清时讲得最多的，也是争议最多的。但不管如何，我认为这方面的成绩可圈可点。第一，制定了一系列南方科技大学管理的基本制度，这形成了南方科技大学独特的治理体系。突出的、与从水同的特征是唯一用理事会治理模式的公立大学；唯一用公开遴选方式选择校长的公立大学；党委书记与校长的职权划分也与一般公立大学明显不同。第二，实施教授治校。公立大学一般讲“教授治学”，但南科大旗帜鲜明地提出“教授治学”，并做了认真的制度安排。重要的制度安排是：校长的校务委员会管理学术干部，学术干部如系主任、书院院长、研究所所长等业务岗，都是没有干部级别的，由校长提名、在校务会上任命。党委管党政干部，党政干部仍然由党委任命。

2、自授学位，让社会评价大学。

“自授学位”是一个符号，代表着国际大学办学的基本方向。但在中国，目前还很难做到。他的首届学生算是幸运的，主要是因为他本人的名气。现在，这项举措已经成为历史，但这种理念，仍在给中国高等教育办学者一个思考。

3、自主招生，实行能力素质与知识并重的选拔机制。

南科大经过实践，把最初的完全自主招生修改为“6+3+1”模式：即采用高考成绩占60%，南科大复试成绩占30%，高中平时成绩占10%。这项改革被实施证明是成功的，且已经成为今天中国高等教育考试制度改革的一个方向。

4、培养创新人才，回答钱学森之问。

1998年，钱学森曾给朱清时写过信，这封信他已经在他最后一次南科大演讲中予以公开。从他五年的实践来看，他是一个“钱学森之问”的回答者，也是一位创新人才培养的“先行者”。这方面他的改革应该是成功的，也是可以复制的。第一，培养统才。四年学制，前两年上宽口径的基础课，后两年自选专业，以利于适应交叉学科的发展，为创新人才打下坚实基础。第二，实行书院制管理，做到社群育人。第三，严格控制“师生比”，确保一个老师所带学生不超过8个。第三，从研究中学习，而不是完全靠课堂教授。南科大通过研究来学习、让本科生都参加老师的科研活动的教学方法、培养人的方法，为创新人才培养作了有益探索。

朱清时在南方科技大学的五年，充满着挑战与陷阱。首批“教改班”学生拒绝参加高考；首批学生先后有4名学生退学；创校顾问三名香港科技大学教授宣布退出；深圳市公开选拔正局级副校长、任命新的党委书记，等，每一次都把朱清时推至风口浪尖，也使他经历一次次的“炼狱重生”。如今，南科大经验事实上成为中国高等教育改革的一块试验田，她已经成为中国近5年来中国高等教育改革的一个缩影。对此，朱清时的贡献永远载入中国高等教育的史册，他也必将成为中国高等教育史上最受人尊敬的大学校长之一。