人类轴心时代，奠基了神话-宗教和哲学-史学的基本思维模式，往后，人类文化的发展，基本是这个模式的体系化、精细化和组织化的发展过程。

印度教-希腊哲学模式，侧重于神话与思辨哲学的循环论、构造论，犹太教-诸子百家模式，则偏重于演化论、模型论的史学和实践哲学。

中古代中国发展了工程范式和手工业模式，积累了经验知识和实践技艺，也形成了社会知识化管理的文官体制，在近现代欧洲，建立了仪器技术和数学方法的实证科学，以及工程技术与艺术设计的工业模式。

（宗教与哲学）

实验科学，建立在1）培根和笛卡尔哲学思维的基石上，而2）彭加勒和胡塞尔的哲学方法，开拓了现代科学理论的哲学基础，在心理物理学、物理生物学等走向了系统科学的思维模式。

在20世纪，认知科学、计算机科学、纳米科学和生物科学等，在交叉与综合的过程，导致了实证分析与系统综合的人工科学范式。

在探索生物系统的形态发生、结构进化，疾病的遗传分析和心身医学，以及中医理论与药物学等，形成了实验方法与系统理论的整合思维。

在4色定理的计算机证明、诺伊曼计算机模型和人工神经网络、细胞信号传导与转基因生物技术等领域的思考，导向了3a）计算机软件和3b）工程生物的研究方法。

也就是，范式1）是17世纪到19世纪的科学，范式2）是理论物理学等科学，而3）是20世纪50年代之后发展起来的新范式。

系统与合成生物学范式和偶合模式，建立于1992年到2002年的哲学与科学、理论与技术探索过程。