人类文明，以文明体（organism of civilization）为发生演变，进化到现代文明；因而，文明进化，也就是文明模式的结构形成、发展与转换过程。

埃及-巴比伦到波斯帝国覆盖 – 后经历希腊化时代和阿拉伯帝国，连接中国，在2侧是印度、希腊（延续至拜占庭 – 后为奥斯曼帝国取代）文明。与印度、波斯接壤的中国，发展了诸子百家和百工技艺的农业文明，而后，与拜占庭和阿拉伯接壤的查理曼欧洲（西罗马），发展出了近现代哲学、科学和艺术的工业文明。

经历不同文明体的演变，人类文化的体系结构形成和组织化，科学的发展是一个范式形成、扩展与转换的过程，比如：

1、物理学，经历：1）力学、声学、光学、热学、电学和磁学等；2）动力学、热力学和电磁学等；3）现代物理学等。

2、生物学，经历：1）博物学、解剖学和分类学等；2）实验生理学、遗传学、生物物理学和生物化学等；3）系统生物学等。

再如，系统生物学为例，一个学科范式的形成与发展：

1）20世纪，理论、概念提出 – 系统生物学与医学、系统遗传学与生物工程等，方法、技术建立 – 数学模型和计算机软件、合成化学与纳米生物学等；

2）1999年-2003年，概念共识和学术共同体形成，系统与合成生物学研究机构建立；

3）2003年-2008年，国际协会、系统遗传学与医学、系统生物科学与工程等研究机构建立；

4）2008年-2013年，全面拓展和全球化时期。

然而，科学范式3个时期划分是核心，即，古代中国的经验科学 – 观察测量与类比模型，近代欧洲实验科学* –仪器技术与数学方法和现代系统科学 –数据操作与计算机模拟等。

附、书籍

人生阅历也许很多，读书也很广；但是，影响深刻或记忆犹新的并不一定很多。于己而言，一是童年时的玩具 - 万花筒和望远镜，二是童话故事和梦幻 – 引出一个生命是什么的问题。1972年已经很具体到翻阅中西医学著作的印象 – 生命和心灵无中生有和中草药的医疗作用，以及社会政治与伦理传统等。

直接影响思想与探索路径的书籍，则已经是中学、大学时代和任教时期：

1）中学，安徒生童话、福尔摩斯探案集、欧几里德几何、趣味物理学、物理世界奇遇记、数学解题的桥梁等；

2）大学，爱因斯坦文集、实验心理学史、生命是什么、科学研究的艺术、伦理学原理、科学革命的结构、科学的社会功能、躯体的智慧、偶然性与必然性等；

3）任教，结构主义、一般系统论、植物学形态问题、生物机器、人类的认知、自然哲学、人论、文化与进化等。

其它书籍或文献，基本是研究，却不是思想的深刻影响。

注*：

16世纪，利玛窦（Ricci，Matthieu，1552-1610）、熊三拨（Ursis Sabbathin de，1575-1620）、艾儒略（Julioaleni，1582-1649）和汤若望（Schall Von Bell，JA，1591-1666）等中西文化双向交流值得深入研究。

-（续，系统生物学 – 观点评述）-