紧接上文：

Materials Studio官方教程：DFTB+——创建DFTB+参数【1】

Materials Studio官方教程：DFTB+——创建DFTB+参数【2】

4、准备短程拟合

确定要使用的电子设置后，即可执行完整的参数化，包括拟合短程电位。第一步是确定短程拟合使用的体系。在本工程中，将尝试创建一个适用于大多数碳氢化合物的参数集合。要实现这一点，需要拟合体系可能包含的不同类型的化学键。

将使用以下体系：

• 氢-氢化学键

• 氢气分子

• 碳-碳化学键

• 乙烷，单键

• 乙烯，双键

• 苯，混合键

• 碳-氢键

• 甲烷

乙烷、甲烷和苯可以从Materials Studio的结构库中导入。

在Project Explorer中，建立一个名为Short range的文件夹。

打开Import Document对话框，导航至Structures\organics，选择ethane.xsd、methane.xsd和benzene.xsd结构文件。单击Open按钮。

氢气和乙烯分子可使用绘制工具创建。

在两个新的3D原子文档中，创建一个H-H和一个H2C=CH2分子，并将其重命名为H2.xsd和ethene.xsd。

现在已建立了设置参数化所需的所有分子的结构。然而，在开始使用它们之前，需要使用DMol3对每个分子进行几何优化。确保分子的结构已经进行优化，从而可以利用参数化对结构进行重现。

单击Modules工具条上的DMol3按钮，选择Calculation，或从菜单栏中选择Modules | DMol3 | Calculation。

打开DMol3 Calculation对话框。

将Task设置为Geometry optimization，Quality设置为Fine，Functional设置为GGA PBE，在Electronic选项卡中，将Basis file设置为4.4。

确保ethene.xsd为当前文档，单击Run按钮。

应对所有输入结构使用相同设置运行该几何优化计算。

使得H2.xsd为当前文档，在DMol3 Calculation对话框中单击Run按钮。

对ethane.xsd、methane.xsd和benzene.xsd文档重复此操作。

当所有的计算任务完成后，应将优化好的结构复制到新文件夹中，并清理工作区。

在Short range文件夹下创建一个名为Structures的子文件夹，将所有已优化好的结构复制到该文件夹内。

从菜单栏中选择File | Save Project，然后选择Window | Close All。

【系列教程】

Materials Studio官方教程：DFTB+——碳纳米管的几何优化

Materials Studio官方教程：Conformers——研究结构-能量之间的关系【1】

Materials Studio官方教程：CCDC——乙内酰脲潜在多晶型的氢键分析【1】

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