illumina

illumina的小RNA测序adapter

illumina的小RNA测序，有多种adapter。如下表所示：

1.  Illumina Single End Adapter 1                   ACACTCTTTCCCTACACGACGCTGTTCCATCT

2.  Illumina Single End Adapter 2                   CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCT

3.  Illumina Single End PCR Primer 1

 AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT

4.  Illumina Single End PCR Primer 2                CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCT

5.  Illumina Single End Sequencing Primer           ACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT

6.   

7.  Illumina Paired End Adapter 1                   ACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT

8.  Illumina Paired End Adapter 2                   CTCGGCATTCCTGCTGAACCGCTCTTCCGATCT

9.  Illumina Paried End PCR Primer 1  

AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT

10. Illumina Paired End PCR Primer 2 

 CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATCGGTCTCGGCATTCCTGCTGAACCGCTCTTCCGATCT

11. Illumina Paried End Sequencing Primer 1         ACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT

12. Illumina Paired End Sequencing Primer 2         CGGTCTCGGCATTCCTACTGAACCGCTCTTCCGATCT

13.  

14. Illumina DpnII expression Adapter 1             ACAGGTTCAGAGTTCTACAGTCCGAC

15. Illumina DpnII expression Adapter 2             CAAGCAGAAGACGGCATACGA

16. Illumina DpnII expression PCR Primer 1          CAAGCAGAAGACGGCATACGA

17. Illumina DpnII expression PCR Primer 2 

AATGATACGGCGACCACCGACAGGTTCAGAGTTCTACAGTCCGA

18. Illumina DpnII expression Sequencing Primer     CGACAGGTTCAGAGTTCTACAGTCCGACGATC

19.  

20. Illumina NlaIII expression Adapter 1            ACAGGTTCAGAGTTCTACAGTCCGACATG

21. Illumina NlaIII expression Adapter 2            CAAGCAGAAGACGGCATACGA

22. Illumina NlaIII expression PCR Primer 1         CAAGCAGAAGACGGCATACGA

23. Illumina NlaIII expression PCR Primer 2   

 AATGATACGGCGACCACCGACAGGTTCAGAGTTCTACAGTCCGA

24. Illumina NlaIII expression Sequencing Primer    CCGACAGGTTCAGAGTTCTACAGTCCGACATG

25.  

26. <font class="Apple-style-span" color="#0000ff">Illumina Small RNA Adapter 1 

GTTCAGAGTTCTACAGTCCGACGATC

27. Illumina Small RNA Adapter 2                    TCGTATGCCGTCTTCTGCTTGT

28. Illumina Small RNA RT Primer                    CAAGCAGAAGACGGCATACGA

29. Illumina Small RNA PCR Primer 1                 CAAGCAGAAGACGGCATACGA

30. Illumina Small RNA PCR Primer 2   

AATGATACGGCGACCACCGACAGGTTCAGAGTTCTACAGTCCGA

31. Illumina Small RNA Sequencing Primer    

 CGACAGGTTCAGAGTTCTACAGTCCGACGATC</font>

32.  

33. Illumina Multiplexing Adapter 1                 GATCGGAAGAGCACACGTCT

34. Illumina Multiplexing Adapter 2                 ACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT

35. Illumina Multiplexing PCR Primer 1.01 

 AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT

36. Illumina Multiplexing PCR Primer 2.01           GTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCT

37. Illumina Multiplexing Read1 Sequencing Primer   ACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT

38. Illumina Multiplexing Index Sequencing Primer   GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC

39. Illumina Multiplexing Read2 Sequencing Primer   GTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCT

40.  

41. Illumina PCR Primer Index 1    

   CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATCGTGATGTGACTGGAGTTC

42. Illumina PCR Primer Index 2   

   CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATACATCGGTGACTGGAGTTC

43. Illumina PCR Primer Index 3   

  CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATGCCTAAGTGACTGGAGTTC

44. Illumina PCR Primer Index 4 

  CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATTGGTCAGTGACTGGAGTTC

45. Illumina PCR Primer Index 5   

 CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATCACTGTGTGACTGGAGTTC

46. Illumina PCR Primer Index 6   

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATATTGGCGTGACTGGAGTTC

47. Illumina PCR Primer Index 7 

 CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATGATCTGGTGACTGGAGTTC

48. Illumina PCR Primer Index 8   

  CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATTCAAGTGTGACTGGAGTTC

49. Illumina PCR Primer Index 9 

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATCTGATCGTGACTGGAGTTC

50. Illumina PCR Primer Index 10 

 CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATAAGCTAGTGACTGGAGTTC

51. Illumina PCR Primer Index 11 

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATGTAGCCGTGACTGGAGTTC

52. Illumina PCR Primer Index 12 

 CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATTACAAGGTGACTGGAGTTC

53.  

54. Illumina DpnII Gex Adapter 1                    GATCGTCGGACTGTAGAACTCTGAAC

55. Illumina DpnII Gex Adapter 1.01                 ACAGGTTCAGAGTTCTACAGTCCGAC

56. Illumina DpnII Gex Adapter 2                    CAAGCAGAAGACGGCATACGA

57. Illumina DpnII Gex Adapter 2.01                 TCGTATGCCGTCTTCTGCTTG

58. Illumina DpnII Gex PCR Primer 1                 CAAGCAGAAGACGGCATACGA

59. Illumina DpnII Gex PCR Primer 2 

AATGATACGGCGACCACCGACAGGTTCAGAGTTCTACAGTCCGA

60. Illumina DpnII Gex Sequencing Primer            CGACAGGTTCAGAGTTCTACAGTCCGACGATC

61.  

62. Illumina NlaIII Gex Adapter 1.01                TCGGACTGTAGAACTCTGAAC

63. Illumina NlaIII Gex Adapter 1.02                ACAGGTTCAGAGTTCTACAGTCCGACATG

64. Illumina NlaIII Gex Adapter 2.01                CAAGCAGAAGACGGCATACGA

65. Illumina NlaIII Gex Adapter 2.02                TCGTATGCCGTCTTCTGCTTG

66. Illumina NlaIII Gex PCR Primer 1                CAAGCAGAAGACGGCATACGA

67. Illumina NlaIII Gex PCR Primer 2    

AATGATACGGCGACCACCGACAGGTTCAGAGTTCTACAGTCCGA

68. Illumina NlaIII Gex Sequencing Primer           CCGACAGGTTCAGAGTTCTACAGTCCGACATG

69.  

70. Illumina Small RNA RT Primer                    CAAGCAGAAGACGGCATACGA

71. Illumina 5p RNA Adapter                         GTTCAGAGTTCTACAGTCCGACGATC

72. Illumina RNA Adapter1                           TCGTATGCCGTCTTCTGCTTGT

73.  

74. Illumina Small RNA 3p Adapter 1                 ATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG

75. Illumina Small RNA PCR Primer 1                 CAAGCAGAAGACGGCATACGA

76. Illumina Small RNA PCR Primer 2 

  AATGATACGGCGACCACCGACAGGTTCAGAGTTCTACAGTCCGA

77. Illumina Small RNA Sequencing Primer            CGACAGGTTCAGAGTTCTACAGTCCGACGATC

78.  

79. TruSeq Universal Adapter 

   AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT

80. TruSeq Adapter, Index 1    

        GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACATCACGATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG

81. TruSeq Adapter, Index 2       

     GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACCGATGTATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG

82. TruSeq Adapter, Index 3   

    GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTTAGGCATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG

83. TruSeq Adapter, Index 4    

    GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTGACCAATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG

84. TruSeq Adapter, Index 5    

 GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACACAGTGATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG

85. TruSeq Adapter, Index 6   

 GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACGCCAATATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG

86. TruSeq Adapter, Index 7   

 GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACCAGATCATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG

87. TruSeq Adapter, Index 8    

   GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACACTTGAATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG

88. TruSeq Adapter, Index 9      

    GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACGATCAGATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG

89. TruSeq Adapter, Index 10 

  GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTAGCTTATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG

90. TruSeq Adapter, Index 11 

GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACGGCTACATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG

91. TruSeq Adapter, Index 12 

GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACCTTGTAATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG

92.  

93. Illumina RNA RT Primer                          GCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

94. Illumina RNA PCR Primer    

   AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACGTTCAGAGTTCTACAGTCCGA

95.  

96. RNA PCR Primer, Index 1 

 CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATCGTGATGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

97. RNA PCR Primer, Index 2

 CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATACATCGGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

98. RNA PCR Primer, Index 3

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATGCCTAAGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

99. RNA PCR Primer, Index 4 

 CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATTGGTCAGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

100.    RNA PCR Primer, Index 5 

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATCACTGTGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

101.    RNA PCR Primer, Index 6 

  CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATATTGGCGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

102.    RNA PCR Primer, Index 7

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATGATCTGGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

103.    RNA PCR Primer, Index 8

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATTCAAGTGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

104.    RNA PCR Primer, Index 9 

 CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATCTGATCGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

105.    RNA PCR Primer, Index 10

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATAAGCTAGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

106.    RNA PCR Primer, Index 11 

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATGTAGCCGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

107.    RNA PCR Primer, Index 12 

  CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATTACAAGGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

108.    RNA PCR Primer, Index 13 

 CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATTTGACTGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

109.    RNA PCR Primer, Index 14 

 CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATGGAACTGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

110.    RNA PCR Primer, Index 15 

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATTGACATGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

111.    RNA PCR Primer, Index 16 

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATGGACGGGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

112.    RNA PCR Primer, Index 17 

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATCTCTACGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

113.    RNA PCR Primer, Index 18 

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATGCGGACGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

114.    RNA PCR Primer, Index 19

 CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATTTTCACGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

115.    RNA PCR Primer, Index 20

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATGGCCACGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

116.    RNA PCR Primer, Index 21

 CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATCGAAACGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

117.    RNA PCR Primer, Index 22

 CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATCGTACGGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

118.    RNA PCR Primer, Index 23 

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATCCACTCGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

119.    RNA PCR Primer, Index 24 

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATGCTACCGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

120.    RNA PCR Primer, Index 25 

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATATCAGTGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

121.    RNA PCR Primer, Index 26 

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATGCTCATGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

122.    RNA PCR Primer, Index 27

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATAGGAATGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

123.    RNA PCR Primer, Index 28

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATCTTTTGGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

124.    RNA PCR Primer, Index 29

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATTAGTTGGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

125.    RNA PCR Primer, Index 30 

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATCCGGTGGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

126.    RNA PCR Primer, Index 31

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATATCGTGGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

127.    RNA PCR Primer, Index 32

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATTGAGTGGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

128.    RNA PCR Primer, Index 33

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATCGCCTGGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

129.    RNA PCR Primer, Index 34

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATGCCATGGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

130.    RNA PCR Primer, Index 35 

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATAAAATGGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

131.    RNA PCR Primer, Index 36 

 CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATTGTTGGGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

132.    RNA PCR Primer, Index 37 

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATATTCCGGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

133.    RNA PCR Primer, Index 38

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATAGCTAGGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

134.    RNA PCR Primer, Index 39

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATGTATAGGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

135.    RNA PCR Primer, Index 40

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATTCTGAGGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

136.    RNA PCR Primer, Index 41

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATGTCGTCGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

137.    RNA PCR Primer, Index 42 

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATCGATTAGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

138.    RNA PCR Primer, Index 43

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATGCTGTAGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

139.    RNA PCR Primer, Index 44

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATATTATAGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

140.    RNA PCR Primer, Index 45

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATGAATGAGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

141.    RNA PCR Primer, Index 46

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATTCGGGAGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

142.    RNA PCR Primer, Index 47

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATCTTCGAGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

143.    RNA PCR Primer, Index 48

CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATTGCCGAGTGACTGGAGTTCCTTGGCACCCGAGAATTCCA

144.     

145.    ABI Dynabead EcoP Oligo                         CTGATCTAGAGGTACCGGATCCCAGCAGT

146.    ABI Solid3 Adapter A      

    CTGCCCCGGGTTCCTCATTCTCTCAGCAGCATG

147.    ABI Solid3 Adapter B 

    CCACTACGCCTCCGCTTTCCTCTCTATGGGCAGTCGGTGAT

148.    ABI Solid3 5' AMP Primer                        CCACTACGCCTCCGCTTTCCTCTCTATG

149.    ABI Solid3 3' AMP Primer                        CTGCCCCGGGTTCCTCATTCT

150.    ABI Solid3 EF1 alpha Sense Primer               CATGTGTGTTGAGAGCTTC

151.    ABI Solid3 EF1 alpha Antisense Primer           GAAAACCAAAGTGGTCCAC

152.    ABI Solid3 GAPDH Forward Primer                 TTAGCACCCCTGGCCAAGG

153.    ABI Solid3 GAPDH Reverse Primer                 CTTACTCCTTGGAGGCCATG

Illumina Small RNA Adapter 1                    GTTCAGAGTTCTACAGTCCGACGATC
Illumina Small RNA Adapter 2                    TCGTATGCCGTCTTCTGCTTGT
Illumina Small RNA RT Primer                    CAAGCAGAAGACGGCATACGA
Illumina Small RNA PCR Primer 1                 CAAGCAGAAGACGGCATACGA
Illumina Small RNA PCR Primer 2 

AATGATACGGCGACCACCGACAGGTTCAGAGTTCTACAGTCCGA
Illumina Small RNA Sequencing Primer 

CGACAGGTTCAGAGTTCTACAGTCCGACGATC

引用：http://www.seq.cn/forum.php?mod=viewthread&tid=3027&extra=