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MiRNA/miRNA*双链在植物miRNA加工中的作用原理
张俊鹏 2024-7-10 09:27
MiRNA/miRNA* 双链在植物 miRNA 加工中的作用原理 小 RNA 是植物基因表达的重要调控因子。其中, miRNA 是一类至关重要的基因,它们被精确地从折叠前体中切除,在植物基因的转录后调节中起着关键作用。进化上保守的 miRNA 在调控植物发育的转录因子、激素信号、小 RNA 通路和对营养缺乏的反应等多种植物过程中发 ...
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从非编码RNA视角探索痴呆症的调控景观
热度 1 张俊鹏 2024-7-8 10:12
从非编码 RNA 视角探索痴呆症的调控景观 痴呆症是一种复杂的神经系统综合征,可通过记忆丧失、思维和决策过程受损严重扰乱日常生活。痴呆症的发病率呈上升趋势,尤其是在 65 岁之前,这凸显了诊断和治疗新策略的重要性。痴呆有多种病因,包括阿尔茨海默病 (AD) 、额颞叶痴呆 (FTD) 、路易体痴呆 (LBD) 和 ...
个人分类: 科普|683 次阅读|1 个评论 热度 1
M&M:基于RNA-seq数据的儿童肿瘤泛癌分类器
张俊鹏 2024-7-5 22:31
MM :基于 RNA-seq 数据的儿童肿瘤泛癌分类器 儿童癌症是高收入国家儿童疾病相关死亡的主要原因。正确的诊断对于治愈尽可能多的儿童和提高生活质量至关重要。然而,诊断肿瘤并不是一件小事,因为儿童可能患有许多肿瘤。虽然儿童癌症本身是罕见的,但在肿瘤实体的集合中,有许多不经常发生的癌症,影响不到 40 ...
个人分类: 科普|894 次阅读|没有评论
第二代转录组数据细胞类型反卷积方法基准测试
张俊鹏 2024-7-3 21:55
第二代转录组数据细胞类型反卷积方法基准测试 组织和器官由不同类型的细胞组成,这决定了它们的结构和功能。表征组织的细胞组成对研究细胞发育、体内平衡和疾病至关重要。近年来,已经开发了几种计算机反卷积方法来估计组织样品的细胞组成,这些组织样品通过大量 RNA 测序 (RNA-seq) 进行分析。反卷积算法将异质样本的 ...
个人分类: 科普|856 次阅读|没有评论
什么是长新冠肺炎?
张俊鹏 2024-7-1 17:59
什么是长新冠肺炎? 定义一种普遍存在的、人们知之甚少的疾病,比如长新冠肺炎,是一项艰巨的任务。患者团体、临床医生和研究人员、政府机构和国际组织使用不同的术语来命名这种疾病,并使用不同的描述来确定什么适合这个术语。目前还没有充分记录的病理生理级联反应,也没有任何充分区分的生物标志物可以明确诊断长新 ...
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isomiR的复杂性:从分类到临床相关性
张俊鹏 2024-6-28 13:16
isomiR 的复杂性:从分类到临床相关性 miRNA 是一种短的、广泛保守的非编码 RNA 分子,通过互补碱基对结合来调控 mRNA 。因此,它们在各种细胞和代谢途径中起着至关重要的作用。在很长一段时间里,人们一直不知道 miRNA 的真正复杂性。 miRNA 按家族、前体和成熟形式分组。然而,随着测序数据的增加,越来 ...
个人分类: 科普|631 次阅读|没有评论
CanCellVar:人类癌症单细胞变异图谱数据库
张俊鹏 2024-6-26 19:14
CanCellVar :人类癌症单细胞变异图谱数据库 癌症的发生与变异密切相关,包括 DNA 中的单核苷酸变异 (SNV) 和 mRNA 中的 AG RNA 编辑。这些变异是细胞增殖和肿瘤发生的重要驱动因素,通常与癌症的进展和生长有关。在肿瘤发生过程中,大量的变异不断积累,导致不同的亚群。分布模式、变异频率和谱在不同 ...
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探索谜团:癌症中lncRNA的历史、现在和未来
张俊鹏 2024-6-26 19:11
探索谜团:癌症中 lncRNA 的历史、现在和未来 长链非编码 RNA (lncRNA) 已经成为我们理解基因组进化、大小和复杂性不可或缺的一部分,这一过程始于 20 世纪 50 年代。测量单倍体基因组 DNA 含量的 C 值研究揭示了有趣的悖论,特别是 DNA 数量与生物体复杂性之间的有限相关性。这种 “C 值悖论 ” ...
个人分类: 科普|801 次阅读|没有评论
Flame 2.0:整合和解释多个来源的功能富集结果
张俊鹏 2024-6-21 09:04
Flame 2.0 :整合和解释多个来源的功能富集结果 功能富集是识别涉及基因或蛋白质组的生物功能、途径、疾病或表型的过程。为此,开发了几种应用程序,例如 DAVID 、 Panther 、 Metascape 、 WebGestalt 、 Enrichr 、 aGOtool 、 AllEnricher 、 GO-Elite 、 MSigDB 、 WEGO 、 KOBAS 、 cl ...
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dbCRAF:人类癌症中放疗反应调控知识图谱
张俊鹏 2024-6-20 09:04
dbCRAF :人类癌症中放疗反应调控知识图谱 癌症是一种复杂的疾病,在世界范围内大大降低了人类的预期寿命。放射治疗 (Radiation therapy , RT) 是治疗复杂疾病的重要方式之一,它可以单独使用,也可以与其他治疗方法联合使用,以治愈肿瘤并缓解癌症患者的肿瘤相关症状。然而,放射治疗的作用不是肿瘤细胞特异 ...
个人分类: 科普|782 次阅读|没有评论

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