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一对搭档：计算与生物
张俊鹏 2022-3-31 18:28
一对搭档：计算与生物 搭档是人类共谋或共做一事的称呼。“志同道合”、“一个好汉三个帮”、“集思广益”、“集成学习”都隐含了搭档的重要性。有人说，搭档的最好形式是优势互补。在生物信息学领域，就有一对最佳搭档：计算与生物。 计算属于计算机领域，如今的计算再也不是算盘和计算器， ...
个人分类: 科普|2141 次阅读|没有评论
癌症内RNA
热度 1 张俊鹏 2022-3-29 09:05
癌症内RNA 癌症（ Cancer ）定义为细胞分裂增殖机制失调，导致细胞增生异常的疾病。除了细胞分裂增殖异常，癌细胞的重要特性之一是具有转移特性，例如转移至其他组织。一般而言，不具备转移特性的肿瘤称为良性肿瘤。仅仅人类本身，已知的癌症就超过了 100 余种。关于众病之王癌症，它还有一个传 ...
个人分类: 科普|4994 次阅读|1 个评论 热度 1
直抵自闭症核心
张俊鹏 2022-3-25 09:11
直抵自闭症核心 自闭症（ Autism Spectrum Disorder ，简称 ASD ）又称孤独症，是一种广泛性发育障碍的代表性疾病。自闭症本身的基因结构是一个不同的等位基因谱，该基因谱由数百个基因内罕见的遗传变异和成千上万个基因位点的常见基因风险所组成。因此，本质上，自闭症是一类基因遗传疾病。   ...
个人分类: 科普|2658 次阅读|没有评论
走进数据科学
张俊鹏 2022-3-22 14:51
走进数据科学 在大数据背景下，作为基础性战略资源的数据科学（ Data Science ）从幕后走向台前。随之而来的是，大数据处理和分析的高级复合型人才需求量骤增。 2016 年，教育部首次在本科专业目录增设“数据科学与大数据技术”。短短 6 年，也就是 2022 年，开设“数据科学与大数据技术”专业的 ...
个人分类: 读书|2851 次阅读|没有评论
Any RNA
张俊鹏 2022-3-18 10:22
Any RNA 物理学中，宇宙中的所有粒子都能被分为两大类：费米子（ fermions ）和玻色子（ bosons ）。其中，电子是典型的费米子，它们无法处于同一状态；而光子是典型的玻色子，一样的光子能够聚集在一起。而在 2020 年，物理学家发现了第三类粒子：命名为任意子（ anyons ）。任意子的特点是既不 ...
个人分类: 科普|4763 次阅读|没有评论
深度学习助力单细胞数据分析
张俊鹏 2022-3-16 11:56
深度学习助力单细胞数据分析 在人工智能（ Artificial Intelligence ，简称 AL ）研究领域，深度学习（ Deep Learning ，简称 DL ）简单的定义为使用深度神经网络为工具的机器学习（ Machine Learning ，简称 ML ）算法。 AI 、 ML 和 DL 之间关系以及内涵分别如图 1 和图 2 所示。 ...
个人分类: 科普|2858 次阅读|没有评论
怎样做开题报告？
热度 1 张俊鹏 2022-3-14 09:10
怎样做开题报告？ 狭义而言，开题报告是本科生和研究生毕业的必备条件。广义而言，开题报告类似于课题或项目申请书，因而也是研究者争取课题和项目的必备文档。如何开好题，一直以来是每个研究者不断琢磨的必修课。早在 2005 年 6 月，美国雪城大学出版社出版了美国雪城大学教育学院两位国际教育研 ...
个人分类: 读书|4544 次阅读|1 个评论 热度 1
怎样做好一项研究？
张俊鹏 2022-3-10 08:39
怎样做好一项研究？ 拿到一个课题或项目，研究者的初心都是想做好这个课题或项目研究。然而，要想做好一项研究，是一件不那么容易的事情。 2021 年 9 月，英国开放大学出版社出版了英国德蒙福特大学 Denscombe Martyn 教授的著作《 The Good Research Guide: Research methods for small-scale soci ...
个人分类: 读书|3517 次阅读|没有评论
NAguideR：填充蛋白质组学数据缺失值
张俊鹏 2022-3-7 17:36
简而言之，缺失值就是数据集中某个或某些属性的值为空。在现实数据中，这种现象普遍存在。比如，医生记录病人的信息时候，有些拿不定的属性值，习惯性的空缺。另外，有些测不出来的属性值，默认为空缺。导致缺失值的原因主要分为三类：完全随机，随机以及非随机。数据既然存在缺失，那么填充这些空缺成为数据预处理的必要 ...
个人分类: 科普|4176 次阅读|没有评论
临床医疗维修店铺
张俊鹏 2022-3-4 09:38
在前面几次，分享了 2017 级生物医学工程专业在昆明医科大学第二附属医院的临床医疗维修实习案例（参见 杰纳瑞 G3L 多参数监护仪维修案例 ， 日本 JMS SP-500 型微量注射泵维修案例 ， 沈大 350—5L 型高亮度冷光源维修案例 ， 成都新兴牌 XX—LG350.2 型内窥镜冷光源维修案例 ， 迈瑞 PM-7 ...
个人分类: 科普|1938 次阅读|没有评论
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