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癌症内RNA 精选

已有 3299 次阅读 2022-3-29 09:05 |个人分类:科普|系统分类:科普集锦

癌症内RNA

 

癌症(Cancer)定义为细胞分裂增殖机制失调,导致细胞增生异常的疾病。除了细胞分裂增殖异常,癌细胞的重要特性之一是具有转移特性,例如转移至其他组织。一般而言,不具备转移特性的肿瘤称为良性肿瘤。仅仅人类本身,已知的癌症就超过了100余种。关于众病之王癌症,它还有一个传记(《癌症传》,图1)。该传记作者悉达多.穆克吉以细胞生物学家的精准、历史学家的视角和传记作家的热情,呈现了癌症编年史。

 

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1 《癌症传》

 

《癌症传》以科普的形式为大众记录了几千年来人类的抗癌战争。如果你不满足于科普,关于癌症,也可以阅读两篇经典综述(《The hallmarks of cancer》和《Hallmarks of cancer: the next generation》)进一步了解。如图2所示,随着癌症研究的深入,癌症特征从6个(《The hallmarks of cancer》)变为10个(《Hallmarks of cancer: the next generation》),未来癌症特征有望进一步扩增。

 

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2 癌症十大特征

 

在宏观层次水平,癌症主要体现在临床表征。那么,在微观层次水平(例如RNA分子),癌症内RNA分子表现如何呢?2021年,Gregory J. Goodall教授和Vihandha O. Wickramasinghe教授共同发表了综述论文《RNA in cancer》(图3)来系统的阐述了RNA对癌症发生和发展的“贡献”。

 

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3 癌症内RNA综述论文

 

以往认为,mRNA加工对基因表达至关重要。现在研究发现,RNA加工在癌症内普遍发生了变化,例如RNA拼接基因和缩短的3’端非编码区普遍发生了突变。除了mRNA,其他类型的RNA(例如miRNAlncRNAcircRNA等)的加工和活性改变也会参与癌症发生和发展过程。该综述的重要特点是,它从编码和非编码RNA视角共同来讨论RNA加工改变对癌症的影响。如果感兴趣,可以参考文献[1]

 

后话

基因测序技术为从分子水平探究癌症提供技术基础,但是究竟是基因影响癌症,还是癌症影响基因,这个又有点类似于“鸡生蛋还是蛋生鸡”问题。

 

参考文献与链接

[1] Goodall GJ, Wickramasinghe VO. RNA in cancer. Nat Rev Cancer. 2021;21(1):22-36.

[2] Hanahan D, Weinberg RA. The hallmarks of cancer. Cell. 2000;100(1):57-70.

[3] Hanahan D, Weinberg RA. Hallmarks of cancer: the next generation. Cell. 2011;144(5):646-674.

[4] https://zh.wikipedia.org/wiki/%E7%99%8C%E7%97%87

 

以往推荐如下:

1. 因果推理综述推荐一篇

2. 生物学家的机器学习指南

3. 基础模型的机遇与风险

4. 一份单细胞数据分析教程

5. R/Shiny交互式生物Web应用程序

6. VOSviewer:文献图谱可视化

7. 卡片式笔记工具:Roam Research

8. 国外知乎:Quora

9. 生信问答平台:Biostars

10. IT问答平台:Stack Overflow

11. 预印本知多少?

12. 借助Bioconductor策划单细胞分析

13. 要选哪个蛋白质互作数据库作为先验信息?

14. mRNA表达无法取代蛋白质表达

15. scIB:单细胞数据融合基准框架

16. 临床医疗维修店铺

17. NAguideR:填充蛋白质组学数据缺失值

18. 怎样做好一项研究?

19. 怎样做开题报告?

20. 深度学习助力单细胞数据分析

21. Any RNA

22. 走进数据科学

23. 直抵自闭症核心

 

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