标题：Models and estimators linking individual-based and sample-based rarefaction, extrapolation and comparison of assemblages

附件：Colwell et al 2012.pdf

保护生态学一个经常要做的事情就是比较两个地区的生物多样性。一般判定的标准就是看两地的物种多样性，然而，数据往往是基于实地的取样调查，而且往往尺度是不一样的。比如这个地区是调查了200平米，那个地区却有2公顷，如此，事实上这种比较是有问题的。因而，本文针对基于个体和样本取样的不同，对不同群落的多样性进行比较。通过模型拟合的方法，进而使得两个群落能同向比较。

本文的研究很严谨，也确实是需要注意的。

尤其是当下很多人使用不同地区不同人员采集的数据，往往得到的是一个species list而不含有任何样地或者样本的信息，这对于准确的模拟是很不科学的，具有很大的人为性。本文给出了一个很好的解决办法。

本文的缺点是太长了……

那么当环境不一致的时候呢？

接：拒=9:2

做rarefaction的函数有：rarefy函数（veganb包），rarc函数（rich包）

或者使用软件: EstimateS (Colwell 2011) and in iNEXT (http://chao.stat.

nthu.edu.tw/softwareCE.html)