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【喜讯篇 IF=14.28 】Aims质谱客户在《Molecular Cell》发表最新文献
崔蕴博 2019-2-28 10:15
2019年1月28日,Cell系列子刊《MolecularCell》在线发表了题为Pacer is a mediator of mTORC1 andGSK3-TIP60 signaling in regulation of autophagosome maturation and lipidmetabolism 的研究论文。 该文主要是由浙江大学基础医学院及浙大附属第二医院孙启明课题组完成,程侠卫博士(课题组博后)是论文 ...
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【分享篇】谷胱甘肽化蛋白的分析方法小结
崔蕴博 2019-2-21 08:57
此文1400字,阅读需要6分钟。 谷胱甘肽是一种小的三肽(c- l-谷氨酰胺- l-半胱氨酸-甘氨酸),以还原形式(GSH)或氧化形式(GSSG)存在,其中两个谷胱甘肽分子之间通过一个二硫键链接。谷胱甘肽通常被认为是维持细胞内还原环境中的氧化还原缓冲液,它保护许多类型的细胞免受活性氧(ROS),外源物质,以 ...
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【方法篇】液质联用(LC-MS)结合BAP方法分析蛋白泛素化修饰
崔蕴博 2019-1-25 14:20
此文1300字,阅读需要6分钟。 泛素化是一种高度保守的多肽(76个氨基酸组成),可通过酶机制与底物蛋白结合,存在于所有真核细胞中。通过一系列的酶级联反应,通过E3或泛素连接酶将泛素部分转移到目标蛋白。泛素连接酶不仅可以将泛素偶联到靶蛋白上,还可以进行重复组装形成多聚泛素链。此多聚泛素链的 ...
个人分类: 蛋白修饰|3726 次阅读|没有评论
【分享篇】用体外手段分析蛋白SUMO化修饰位点
崔蕴博 2018-12-11 10:25
此文1200字,阅读需要5分钟。 SUMO化蛋白翻译后修饰,又称为SUMOylation,在细胞功能中起着不可或缺的作用,与DNA修复、细胞内转运、细胞信号转导和应激反应密切相关。哺乳动物细胞中比较常见的三种SUMO化修饰类型:SUMO1、SUMO2和SUMO3,其中SUMO2和SUMO3有96%的同源性,而SUMO1和其他两种修饰只有45%的序列同源性 ...
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【讨论篇】定量蛋白质组学:在基础科研和医疗应用中的机遇与挑战
崔蕴博 2018-12-4 10:54
最近有科学家讨论近十年来质谱为基础的蛋白质组学技术的发展,反思现有的挑战和局限,并探讨当前的问题以及定量蛋白质组学在分子系统生物学、临床研究和个性化医疗中的未来应用。 蛋白质构成细胞主要分子机制,是生物分子药物主要的靶向目标。它们被组织起来在不同的功能模块和信号网络中,协同起来调控细胞功能以及确 ...
个人分类: 蛋白质组学|5235 次阅读|没有评论
工具篇:质谱上机前酶解处理方法之比较
崔蕴博 2018-11-25 22:49
通过高效液相串联质谱(LC-MS/MS)对生物系统中全蛋白进行定性定量,已经成为一种主流的分析工具。 大规模的蛋白组研究通常依赖于蛋白被消化成肽段,然后进行后续的定性定量分析。因此蛋白的消化效率对于后续质谱实验至关重要,质谱的结果与样本类型,裂解条件,酶解消化和分馏方法等等密切相关,最近有 ...
个人分类: 蛋白质组学|16109 次阅读|没有评论
干货篇:蛋白质谱之“搜库”
热度 1 崔蕴博 2018-11-21 11:08
此文1900字,阅读需要7分钟。 什么是最常见的蛋白质谱和Shotgun? 蛋白质谱已经应用在各个研究领域,但是最常用的还是Shotgun法鉴定蛋白, 下图1中是鸟枪法蛋白质组学的实验步骤和常用的分析流程,样本蛋白经过蛋白酶水解后成肽段,经过一维或者多维的色谱法分离,肽段被电离后被碎裂形成特征 ...
个人分类: 蛋白质谱|23689 次阅读|3 个评论 热度 1
去污剂对膜蛋白复合物的影响
崔蕴博 2018-11-15 12:06
此文1500字,阅读需要7分钟 膜蛋白在信号转导,离子转运和细胞黏附过程中发挥重要作用,与膜蛋白互相作用的蛋白起着重要调控作用,近些年科学家已经广泛使用质谱手段(LC-MS/MS)来鉴定膜蛋白结合蛋白。与可溶性蛋白不同,鉴定这些膜蛋白复合物需要使用去污剂,膜蛋白在去污剂作用下容易解折叠,聚集。 ...
个人分类: LC-MS/MS|7967 次阅读|没有评论
外泌体提取方法小结
崔蕴博 2018-11-9 11:51
此文字数1200字,阅读需要5分钟 随着近几年大家对外泌体的认识和了解,外泌体吸引了诸多科学家的注意力,因其能够为癌症早期诊断和治疗提供有意义的生物标记物。那么对于研究外泌体的科学家来说,第一步,提取外泌体至关重要,今天我们分享一篇关于外泌体的提取方法到底对后续研究有什么影响?是否能给在做外 ...
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