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技术革新之CNS常客:魔剪CRISPR和冷冻电镜

已有 2249 次阅读 2016-12-27 17:05 |系统分类:博客资讯

 今天跟大家一起聊聊技术更新这个话题每天关注Cell、Nature、Science(合称CNS)等顶级期刊是咱们生物界的同事们的常事。你会发现近两年,基因编辑的“魔剪”CRISPR,和冷冻电镜可是这些期刊的“常客”。前段时间基因编辑技术从媒体到各个学校和研究所的实验室一直很火爆哈,而前几天各个网站都有“冷冻电镜+清华大学=7篇Cell、Nature、Science | 附施一公院士最新综述“这样标题的新闻和文章。毫无疑问,体现出CRISPR和冷冻电镜技术在研究中起着重要的作用。

2015年6月24日,在此领域有发言权的剑桥大学分子生物实验室的Nagai研究组《自然》文章称他们将剪接体组装过程中所涉及的一个中心复合物tri-snRNP的分辨率提高到5.9埃1埃相当于1米的十亿分之一Nagai的这项工作较之以前有了飞跃引起业界轰动。

但这个突破还是只能看到蛋白质的二级结构,看不到氨基酸。而2015年8月施一公团队的2篇science得到的结果不仅将精度由5.9埃提高到3.6埃,可以把许多氨基酸看得清清楚楚。更重要的是,其解析对象是真正的剪接体,而不是Nagai团队所取得的参与剪接体组装过程的复合物。这是第一次在近原子分辨率上看到了剪接体的细节。前后改团队用7篇文章论述了剪切体的故事。

为什么研究多年的世界难题会被施一公团队解开


研究蛋白质结构有三种主要方法:X射线晶体衍射、核磁共振以及单颗粒冷冻电子显微镜(冷冻电镜)。早在2007年,清华大学就在上述三种方法中选择了重点发展冷冻电镜技术(当时冷冻技术还很不成熟),如今清华拥有世界最大的冷冻电镜系统。施一公教授在接受采访时说:“如果没有冷冻电镜技术,就完全不可能得到剪接体近原子水平的分辨率。”不得不说团队在技术选择上是多么的有远见和格局

不管是做研究还是开公司,一定要有长期和短期发展的格局魔剪”CRISPR为什么有的实验室分分钟就是CNS,这个技术的确是非常有效有用的,而且在医学和临床已经迈出了一大步,相关文章和应用也是不计其数。韩春雨老师的事情一直也是非常的火热,据说17年1月底应该会有一个结果。

在公司这一块如果不是illumina公司在测序仪的革新,就不会有如今这么多的NGS公司。国内的基因测序相关产业,长时间处在基因测序产业链的中下游,直至华大于2013年收购美国的测序仪上市公司CG,我国的基因测序相关产业才开始真正布局上游。”从现在看来华大当时在还是非常有远见的,如今也开始有自己的测序仪,大家都期待华大越做越好。

如今NGS的公司,如果谁能带来技术上的革新,那绝对的是行业领先的。就单从建库这个来说,目前基本还是靠人工制备上机文库,一个熟练有经验的建库者可以在一家新的NGS公司轻轻松松找到一份不菲的工作。最近全球领先的医疗公司BD,在P4 China 2016国际精准医疗大会上推出全球第一款通量灵活、全自动一体化的文库制备仪BD CLiCTM 系统,只需一键启动,即可全自动完成所有样本的文库制备工作,极大缩短了批量处理样本的时间,简化操作流程,全面突破了目前基因建库面临的技术难点,我们相信这个绝对有是技术有市场的。




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