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长链非编码RNA研究领域的污点
张天翼 2014-6-20 12:37
Science 上个月声明撤销 UC Riverside Frank Sauer 实验室的两篇分别在 2004 和 2006 年发表的文章。我有些吃惊,因为自己还对 2006 年那篇文章有印象。 2006 年那篇文章主要讲长链非编码 RNA 能与蛋白结合,并参与调节基因的表达调控。这项工作是用果蝇做的,有分子机理,也有体内功能的研究结果, ...
个人分类: 分子遗传|2429 次阅读|没有评论
撬动染色体
张天翼 2014-4-27 11:54
在表观遗传学( epigenetics) 研究的早期,研究者对 ploycomb (PcG) 蛋白很感兴趣,因为编码这一类蛋白的基因被突变以后,最容易受影响的基因包括 Hox genes 。 Hox 的改变会导致动物的体节的增删,例如一些 PcG 突变果蝇会多长一双翅膀。 基于这些现象和一些后续的遗传学研究,我们不难理解, PcG 的主要 ...
个人分类: 分子遗传|2095 次阅读|没有评论
细胞对梯度信号的响应
张天翼 2014-4-17 21:25
动物器官形成的基础是细胞的分裂与分化,而信号分子在这过程中起到了联系、沟通、指挥的作用。信号分子可以是远程的,例如胰岛素和小分子激素,它们进入循环系统,全身跑;有的信号分子是短程的,它们的影响范围和作用浓度需要得到严格的控制,例如 Wnt,TGF-beta, hedgehog 等。这些短程信号分子的作用范围或者活性的失 ...
个人分类: 分子遗传|2282 次阅读|没有评论
为什么大象不容易得癌症?
张天翼 2014-3-22 12:37
这不是脑经急转弯。除了大象,还有鲸鱼。 http://en.wikipedia.org/wiki/Peto's_paradox 原因还不很清楚。其中的一种解释是:巨型动物体内细胞的供氧程度比小型动物要低,从而降低了活性氧化物导致 DNA 损伤的几率
个人分类: 分子遗传|2009 次阅读|没有评论
重启基因组
张天翼 2014-2-16 11:52
像吾等“电脑土帽”在遇到电脑变慢或者某些地方不对劲的时候,就会把电脑重启一下,通常电脑的状态就会变得好一些。如果每天要重启两次以上,那就说明换电脑的时候到了。 重启电脑的道理很简单:把之前的错误或者不良循环抹掉,让状态变好。我们的基因组每时每刻都受到刺激或者攻击,某些细胞的编码信息会变乱。如果能 ...
个人分类: 分子遗传|2402 次阅读|没有评论
个体内细胞的基因组演化
热度 1 张天翼 2014-2-15 21:45
在我上大学所用的教科书告诉我 : 一个动物体内除了极少数细胞 ( 例如免疫细胞或癌细胞 ) 的基因组会变化以外,别的细胞的基因组是一样的,细胞的形状和功能的不同取决于基因表达的调节。不知道现在关于个体的基因组的保真性是如何描述的。 我们都不喜欢“盲人摸象”的研究模式,但不幸的是,在研究新事物的时候 ...
个人分类: 分子遗传|3254 次阅读|4 个评论 热度 1
两篇结果有矛盾的论文的不对称引用
热度 1 张天翼 2014-2-10 12:53
最近看了一些溶酶体酸化与 mTOR 方面的论文,以下两篇论文分别发表在 2011 年 Science 和 2012 年 JBC ,时间相差 7 个月。从 google 的结果来看, Science 那篇被引用了 163 次,而 JBC 那篇只被引用了 4 次。 JBC 的论文后发表,他们用了一定篇幅质疑 Science 论文的主要结果: V-ATPase ...
个人分类: 分子遗传|3618 次阅读|2 个评论 热度 1
研究转录因子靶基因的两种方法
张天翼 2014-2-6 11:50
转录因子可以影响很多基因的表达,可以指导很多不同的生物学过程,包括细胞分化、细胞分裂、大小、代谢等等。研究转录因子的功能需要多种生物学方法,比较容易给研究者带来希望的技术,我认为,有两种:检测 mRNA 变化的 DNA 芯片( chipor microarray )和检测转录因子的 DNA 结合的染色体免疫共沉淀 +DNA 芯 ...
个人分类: 分子遗传|14101 次阅读|没有评论
Jay Leno
张天翼 2014-1-31 11:39
在春节之际, NBC 的夜间脱口秀主持人 JayLeno 也要退休了。 JayLeno 在美国的成年人中绝对是名人。总统随时换都没问题,但 JayLeno 退休了会让很多人在一段时间内不习惯的。 美国的脱口秀可能目前还是难以被中国山寨,因为它的很大的篇幅是用于取消公众人物的,主要是总统、议员、州长、明星等等。但要弄清楚 ...
个人分类: 海外生活|2199 次阅读|没有评论
对科技过度宣传的两个例子
张天翼 2014-1-25 14:15
在说这两个例子之前,我突然又想起了另一个例子。那就是根据一两年前的一项网络调查结果,网民认为人类历史上最伟大的发明是 iphone 。我就不想说什么了。 第一个例子是几天前 google 宣布他们研究出了一种可能会在未来 10 年左右能给糖尿病人带来方便测量血糖的隐形眼镜。产品都已经做出来了,怎么还有等 10 ...
个人分类: 海外生活|3732 次阅读|没有评论

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