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受到中国水产科学研究院南海水产研究所的邀请,千年基因于11月24日对该单位进行学术访问及交流。千年基因总部Macrogen集团CEO Dr. HyungTae Kim、NGS项目总监Dr. Jinhee Bae及千年基因中国区CEO于越与该单位的水产研究专家共同探讨了水产动物基因组学研究的现状,以及二代、三代测序技术在水产动物基因组项目中的应用。
水产动物基因组图谱的绘制,将极大地推动其基因资源的有效开发和深度研究利用,并为基因组辅助育种研究、优良品种快速培育奠定重要的理论基础。然而,高度复杂的水产动物基因组也为基因组测序和组装带来了较大的挑战。
对此,Dr. Kim表示千年基因最专业的de novo项目解决方案可轻松应对这一技术难题。首先,千年基因可提供最全面的测序平台,既包括de novo项目常用的二代平台HiSeq 2000/2500及454/454+,也包括拥有最长读长的三代平台PacBio RS II。目前千年基因应用该平台的最高读长可达40Kb,如此长的读长可轻松跨越高杂合和高重复区域,从而得到更完善的基因组序列信息及功能基因信息。其次,千年基因拥有最成熟的大片段文库构建及测序方案,能够延长Scaffold N50长度,从而显著提高组装结果。第三,千年基因的信息分析团队对高杂合、高重复的复杂基因组组装拥有非常丰富的方案设计和组装经验,同时拥有丰富的多平台数据高效整合组装及分析经验。另外,千年基因丰富的国际基因组项目研究和执行经验,使其能够针对物种基因组的杂合度、序列重复度、GC%等情况制定最佳的研究方案。
通过本次学术访问和交流,南海水产研究所的研究人员对千年基因开展de novo项目的综合实力和经验表示了充分信任与高度认可,并表示今后双方将开展更多项目合作,以推动水产动物基因组学的发展,并为我国水产动物的遗传育种做出贡献!
来源于千年基因官网:千年基因到访中国水产科学研究院,共促水产动物基因组学发展
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