ncRNADrug：与耐药和药物靶向相关的实验验证和预测ncRNA 

癌症是世界范围内导致死亡的主要原因，对人类健康构成严重和长期的威胁。化疗仍然是癌症患者的一线治疗方法。然而，耐药的出现显著影响化疗的疗效，最终导致治疗失败和复发。癌细胞产生耐药性的机制多种多样，如药物外排、DNA修复等。 

越来越多的证据证明，非编码RNA(ncRNAs)，尤其是microRNAs (miRNAs)、长链非编码RNA (lncRNAs)和环状RNA(circRNAs)在调节各种癌症的发生和发展中起着至关重要的作用，并与药物耐药性密切相关。例如，miR-149-3p通过靶向CDKN1A和TIMP2促进卵巢癌的cisplatin耐药。此外，对ncRNA的扰动可以直接或间接地影响下游靶点和信号通路，使ncRNA成为一类新的药物靶点。例如，Sorafenib介导一组人类癌细胞系中lncRNAs (GAS5、HOTTIP和HOXA-AS2)的失调。 

由于ncRNA在调节药物耐药中的重要性，已经开发了多个收集ncRNAs与药物之间关联的数据库，包括SM2miR、D-lnc、ncDR、miREnvironment和NoncoRNA。然而，这些数据库倾向于主要关注一种关联，要么是药物反应，要么是药物靶点。没有一个数据库系统地将这两种类型的关联与最新数据集成在一起。因此，构建与耐药相关的ncRNA、药物靶向的ncRNA和潜在的药物联合治疗耐药癌症的ncRNA集中资源是必要的，也是非常可取的。为了填补这一空白，Cao等人开发了ncRNADrug（图1，http://www.jianglab.cn/ncRNADrug），它收集并预测了ncRNA和药物的关联。 

图1 ncRNADrug数据库流程 

参考文献

[1] Cao X, Zhou X, Hou F, Huang YE, Yuan M, Long M, Chen S, Lei W, Zhu J, Chen J, Zhang T, Guo AY, Jiang W. ncRNADrug: a database for validated and predicted ncRNAs associated with drug resistance and targeted by drugs. Nucleic Acids Res. 2023 Nov 11:gkad1042. doi: 10.1093/nar/gkad1042.

以往推荐如下：

1. 分子生物标志物数据库MarkerDB

2. 细胞标志物数据库CellMarker 2.0

3. 细胞发育轨迹数据库CellTracer

4. 人类细胞互作数据库：CITEdb

5. ​EMT标记物数据库：EMTome

6. EMT基因数据库：dbEMT

7. ​EMT基因调控数据库：EMTRegulome

8. RNA与疾病关系数据库：RNADisease v4.0

9. RNA修饰关联的读出、擦除、写入蛋白靶标数据库：RM2Target

10. 非编码RNA与免疫关系数据库：RNA2Immune

11. 值得关注的宝藏数据库：CNCB-NGDC

12. 免疫信号通路关联的调控子数据库：ImmReg

13. 利用药物转录组图谱探索中药药理活性成分平台：ITCM

14. AgeAnno：人类衰老单细胞注释知识库

15. 细菌必需非编码RNA资源：DBEncRNA

16. 细胞标志物数据库：singleCellBase

17. ​实验验证型人类miRNA-mRNA互作数据库综述

18. 肿瘤免疫治疗基因表达资源：TIGER

19. 基因组、药物基因组和免疫基因组水平基因集癌症分析平台：GSCA

20. 首个全面的耐药性信息景观：DRESIS

21. 生物信息资源平台：bio.tools

22. 研究资源识别门户：RRID

23. 包含细胞上下文信息的细胞互作数据库：CCIDB

24. HMDD 4.0：miRNA-疾病实验验证关系数据库

25. LncRNADisease v3.0：lncRNA-疾病关系数据库更新版