miRScore：一种快速精确的miRNA验证工具 2025-12-09

miRScore ：一种快速精确的 miRNA 验证工具   微小 RNA （ miRNA ）是一类小分子非编码 RNA ，它们在真核生物中调控基因表达。这种调 ...

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HMFGraph：恢复生物网络的贝叶斯新方法 2025-12-09

HMFGraph ：恢复生物网络的贝叶斯新方法   数据结构和多个变量之间的条件依赖关系可以轻松使用图模型进行了探索。高斯图模型（ GGM ）用于网络 ...

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phylobar：组学研究的多分辨率条形图的R包 2025-12-09

phylobar ：组学研究的多分辨率条形图的 R 包   堆叠条形图被广泛用于可视化微生物群落结构。这些图表将每个条形——代表单个样本——分成不 ...

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SCALD：通过循环因果结构学习推理生物调控网络 2025-12-03

SCALD ：通过循环因果结构学习推理生物调控网络   生物网络是模拟生物分子之间复杂调控关系的有效工具，例如基因调控网络（ GRN ）、信号转导网 ...

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基于深度学习的基因扰动效应预测并没有比简单的线性基线好 2025-12-01

基于深度学习的基因扰动效应预测并没有比简单的线性基线好   大型语言模型在知识表示方面的成功激发了将基准模型概念应用于生物学的努力。已发布几个 ...

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单细胞RNA测序的大规模基准测试分析 2025-12-01

单细胞 RNA 测序的大规模基准测试分析   随着单细胞 RNA 测序（ scRNA-seq ）进入其青少年时期，我们正在见证实验和数据集的规模和复杂性的 ...

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转录组学的生物信息学视角：批量与单细胞 RNA 测序分析的全面综述 2025-12-01

转录组学的生物信息学视角：批量与单细胞 RNA 测序分析的全面综述   转录组是一个动态且复杂的实体，在细胞生物学中起着核心作用。转录组由细 ...

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SDMap：空间药物扰动图谱数据库 2025-11-27

SDMap ：空间药物扰动图谱数据库   组织内细胞的组成、空间排列、状态和相互作用高度异质性，而这种异质性正是导致细胞药物反应差异和治疗效果多 ...

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