SCALD：通过循环因果结构学习推理生物调控网络 2025-12-03

SCALD ：通过循环因果结构学习推理生物调控网络   生物网络是模拟生物分子之间复杂调控关系的有效工具，例如基因调控网络（ GRN ）、信号转导网 ...

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基于深度学习的基因扰动效应预测并没有比简单的线性基线好 2025-12-01

基于深度学习的基因扰动效应预测并没有比简单的线性基线好   大型语言模型在知识表示方面的成功激发了将基准模型概念应用于生物学的努力。已发布几个 ...

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单细胞RNA测序的大规模基准测试分析 2025-12-01

单细胞 RNA 测序的大规模基准测试分析   随着单细胞 RNA 测序（ scRNA-seq ）进入其青少年时期，我们正在见证实验和数据集的规模和复杂性的 ...

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转录组学的生物信息学视角：批量与单细胞 RNA 测序分析的全面综述 2025-12-01

转录组学的生物信息学视角：批量与单细胞 RNA 测序分析的全面综述   转录组是一个动态且复杂的实体，在细胞生物学中起着核心作用。转录组由细 ...

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SDMap：空间药物扰动图谱数据库 2025-11-27

SDMap ：空间药物扰动图谱数据库   组织内细胞的组成、空间排列、状态和相互作用高度异质性，而这种异质性正是导致细胞药物反应差异和治疗效果多 ...

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DAZZLE：使用 dropout 增强改进基因调控网络推理 2025-11-24

DAZZLE ：使用 dropout 增强改进基因调控网络推理   从表达数据中推断基因调控网络（ GRN ）提供了体内基因间相互作用的上下文模型。理解 ...

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scUnified：单细胞数据分析的AI标准化资源 2025-11-22

scUnified ：单细胞数据分析的 AI 标准化资源   随着单细胞 RNA 测序（ scRNA-seq ）技术的快速发展，现在可以在前所未有的分辨率下表 ...

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GraphComm：使用图深度学习方法预测细胞通讯 2025-11-22

GraphComm ：使用图深度学习方法预测细胞通讯   了解多细胞生物及其功能能力需要深入了解细胞活动。这可以通过研究将诱导反应和下游效应的信号事 ...

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