［今年上半年我们学校的国家重点实验室架设了一组集群服务器，通过申请我拿到了一个账户，开始慢慢了解集群服务器］

集群服务器是为了解决单个服务器计算能力有限的问题，把多台服务器并联成一组服务器，然后通过管理软件，实现同时在多台服务器上运行程序，达到成倍提高计算能力的目的。

我们学校的集群服务器是由10多个节点构成，每个节点包含16核CPU，64G内存，计算能力可观。不过对我而言，更重要的是怎么用。

首先，集群服务器是可以当作若干个独立服务器来使用的，可以完全无视它们是一个集群。然后在每个节点上单独运行程序。这是刚开始使用集群服务器，还不了解bsub的用法时，我采取的策略。

正常的集群服务器使用方法是提交任务到任务管理系统，任务管理系统会在系统存在空闲资源时运行你的程序，否则就处于等待状态。任务管理系统是可以将你的任务分配到多个节点上。

提交任务的方法是bsub后面跟上要运行的程序，比如

bsub muscle -in input.fasta -out output.fasta

当然，bsub有很多参数，功能强大，只是内容太多，看起来令人头疼。常用的参数包括：

1. -J 跟上任务名称。默认任务名称是bsub提交的命令，往往太长不易阅读，用-J加上简短任务名称更好一些

2. -n 设定请求的CPU数量，bsub管理系统会根据请求分配CPU数量。

3. -cwd 设定程序运行的当前目录，感觉这个参数还是很必要的。

4. -o 程序运行输出文件

5. -e 程序运行错误输出文件

比如

bsub -J test -n 16 -cwd /path/to/test/ -o /path/to/test/stdout.txt -e /path/to/test/stderr.txt COMMANDS

在我运行一些程序后，发现一个奇怪的现象，程序输出到STDOUT的结果最后会写到-e 文件中，而不是-o 文件中，不知为何。

另外，如果需要查看有哪些任务正在运行，以及有哪些任务在等待运行，可以用bjobs命令。

如果要查看各个节点的负载情况，可以用lsload命令。