博文
【bio】交叉学科盛行时代生命科学研究者的立足点
精选
||
【引言】
武大生科教授研究生蛋白质组课的非常有个性的女教授Prof Guo一次不禁零碎的感叹，蛋白质组学越做到最后就越是computer dependent。本人涉足蛋白质学生物信息分析的好机油小赫赫吐槽，关键在于实验、设备（质谱、色谱柱之类的草泥马太重要了），后续生物信息分析超无力，杯水车薪...
在交叉学科盛行当道的时代、在信息爆炸的时代，生命科学研究者该如何立足？——生命科学研究者是交叉学科里新鲜血液供给者，是新天地的开辟者。
Trial and error——生命科学研究的本质
Trial and error这是生命科学研究的本质，也是此学科的一大限制。基本上因为生命过程实在是太复杂，如何去啃这个巨大的生命研究问题？能想到的恐怕也只有不断尝试了。比如做晶体结晶的同仁们恐怕深有体会，上百个结晶条件，也许都不能得到想要的宝贝。
生命过程是复杂的，任何调控都是精准的。因此纵观生命科学研究，一个高频关键词就是target！靶向！定位！等等类似的关键词。癌症的靶向定位、HIV的靶向、基因治疗的靶向等等，一直都是生物医学研究者们梦寐以求的效果。
生命科学研究过程是反复尝试的，是螺旋上升的。因此在上述靶向治疗研究者的公开讲座上或者宣讲上，不少会有这样傻傻但很可爱的本科生提问：“请问您当初是怎么想到这个研究的？” 而基本上，研究者只好双手一摊，悻悻地回答：“我们反复尝试出来的”。
而多少充满奇思妙想、怀揣雄心壮志的的ph.D candidate败倒在反复尝试、不断求索的路上？经受不起时间的折磨与拖拉？心里想着：我的研究再犀利再具有前景，但如果能有一个标杆来指引、辅助研究，那该多好。
逻辑的魅力——计算机科学以及信息技术
什么是逻辑的魅力？我写的代码，只要没有逻辑错误，就一定能行驶我想要的函数功能。
一个人基因组3G，做一个疾病（比如肺癌）的研究，至少100个样本是需要的。那这么庞大的数据，即基因表达差异信息，该如何分析？所有生物研究数据太多、太复杂，需要数学理性统计分析（比如小儿科正交试验）、需要计算机语言工具（比如bioperl）来辅助解析爆炸似信息。在生命科学研究的层层迷雾中，需要逻辑的理性之光来指引！所以出现了一个很无奈的现状，在纯生科院里，会一点生物信息的同学就被膜拜成了神。
不过更奇妙的是，从事IT等行业的程序猿们自我调侃为：码农。不断不断、一直一直、重复重复地写着相似代码，苦不堪言。心里想着：我写的这些代码有什么意思？我会的别人也会，我不会的别人还是会，要是有个超赞的操作对象，那该多好？
让别人玩我玩剩了的——生科的尊严
要说这是生科的尊严，也可以说这是生科人的无奈。生物信息因其杂种优势，在基因组学时代、信息爆炸时代背景下，独领风骚。世界上专门有这么一波数理统计、计算机编程的人们，只做data-mining。就是专门分析生物学家们做出来的数据，挖掘庞大信息背后的潜在规律。当然还有做的更“过分的”，就是程序猿们指导生物家们做实验。仗着理性之光、逻辑魅力，让实验室工人帮自己做bench-work，来验证以及实现数学模型。于是生物家们沦为程序猿们的工人，即工人的工人。
那是不是意味着生物学家们要跟这帮人去竞争、去比信息挖掘，我想，绝对是生科人自寻死路。对于年老的一代工作者，大可以去搞合作项目，跟计算机学院合作、跟华大基因合作等。对于年轻的一代，请自觉去上各类数学统计、计算机编程的课程。2010年听闻武大生科本科生课程引入《数据结构》一课，当时我心里窃喜，武大生科终于觉悟了麼？但是好景不长，听闻孩子们挂科不少，作为试行的小白鼠，立刻决定次年不再开设此课程，让我无语了一会。
对于普遍广大的纯生科人而言，如果没有能力去涉足编程、统计，而你又想涉足交叉学科，那就要想好自己未来的课题能给这个领域带来什么新鲜血液？开辟什么新航道？生物信息学、合成生物学、系统生物学里研究的对象本质都是生物，脱离生物背景和意义的任何数学统计、任何工具，都是没有意义的。
交叉学科这出戏里的演员（生物信息人）再好，但是没有剧本、没有舞台，又怎么能唱出余音绕梁？所以当诸位纯生科人看见生物信息的同学时，诸位可以膜拜他们羡慕他们，毕竟这是催化剂角色的生物信息人应该得到的膜拜。但是诸位不可妄自菲薄或者自惭形秽，膜拜他们不一定是以否定自己为基础，因为这第一是对自己的妄自菲薄，第二生物信息人并没有被你抬高而是因为你降低自己而已。
总之，自觉拾起生科人的尊严。
[flash]http://www.xiami.com/widget/0_1769517862/singlePlayer.swf[/flash]
p.s. 游荡在交叉学科
https://blog.sciencenet.cn/blog-635657-521710.html
上一篇：感恩节特献，听妈妈的话，早睡早起身体好
下一篇：【乱扯】单细胞水平研究确实靠谱！
