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牡丹基因组计划

已有 8227 次阅读 2013-2-6 13:52 |系统分类:观点评述| 基因组, 牡丹

 

说到花卉,人们自然而然会想到牡丹。在中国的历史上,只有牡丹可以不用在前面加限定词而直接称之为“花”,如同“江”“河”分别指长江和黄河一样。在唐朝牡丹就已经确立了其作为国花的地位(只是没有被冠名罢了!)。就是这样一种与人们的生活密不可分的国魂花卉,在基因组时代的今天,其基因组还没有人敢挑战。究其原因,主要是牡丹基因组大(13-16Gb),杂合性高,牡丹人研究经费有限。

最近,中国的牡丹人组成了牡丹基因组计划工作组(Peony Genome Working GroupPGWG),拟整合全国之力实施牡丹基因组计划。其基本思路是分离单条染色体,建立基因组文库,然后用高通量和高可靠性的测序技术相结合的方法测定每条染色体的全序列。这项工作全部完成最保守估计需一千多万元。尽管这个资金还不知道着落何方,但牡丹人已经下决心,2013年迈出实质性的一步:走通单染色体测序的技术环节。现在,他们正紧锣密鼓地研讨技术方案,可望年内取得重要进展。

如果牡丹人的技术获得成功,植物基因组将获得飞跃发展。目前,植物基因组由于高杂合性、多倍体等问题而受到严重阻碍。单染色体技术绕开了这些问题,看到了希望的曙光。当然,单染色体技术还会遇到一系列的挑战。

对于像牡丹这样的大基因组来说,一千万的投入不算多。据说毛竹的基因组投入已经接近亿了,还没看到希望。牡丹已经从原来的观赏转身为集药用、油用等许多用途于一身的经济植物。从非常看好的市场前景看,这点投入与可能获得的巨大产出相比是微不足道的。

祝愿牡丹基因组计划获得完满成功!



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