1679年腓特烈·威廉一世（Friedrich Wilhelm I, 1620-1688）下令建立。1889至1921年，在植物分类学和地理学泰斗恩格勒（Adolt Engler, 1844-1930）的管理下，植物园达到了发展的顶峰。他建立的恩格勒系统是首个尝试从藻类到被子植物进行分类的较完整系统，至今仍广泛应用于世界各国许多植物标本馆和植物志。他研究了世界几个地区尤其非洲的植物群，扩大了植物区系分布的知识。1897年起，他指导植物园搬至达勒姆（Dahlem），并指导设计了占地13 公顷的植物地理区，按世界植物的地理区划规划设计，分区栽培代表六大洲（除南极洲）的植物，每个洲内又分为不同国家和地区，共32个分区，包括12种岩石生境、8种森林类型及7种荒地草原，涵盖了约6,400种北半球温带植物，堪称“世界植物区系缩影”。

热带植物馆

法兰克福棕榈馆

蕨类植物馆

热带森林温室灌木丛 

 温室热带作物馆

 苏铁馆

热带温室低地雨林

月桂林