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AbMole科研用抗生素篇丨突破细菌耐药困局,创新抗生素试剂详解

已有 211 次阅读 2026-9-11 14:31 |系统分类:科研笔记

随着细菌耐药性的不断进化,传统抗生素的效能日益受到挑战。碳青霉烯酶产生菌、多重耐药革兰氏阴性菌及耐甲氧西林金黄色葡萄球菌等耐药株的广泛出现,迫切需要新型作用机制的抗生素用于基础研究。近年来,铁载体头孢菌素、新型四环素衍生物、三氮杂苊烯类拓扑异构酶抑制剂及新一代恶唑烷酮类等创新化合物相继进入科研视野,为抗耐药菌机制研究提供了多元化工具。AbMole为全球科研工作者提供各种高纯度新型科研用抗生素试剂助力耐药菌抑制机制与动物实验新型干预策略的探索。

一、铁载体头孢菌素

铁是细菌生长必需的微量元素,革兰氏阴性菌通过铁载体摄取系统(如FiuFepACir等外膜受体)主动从环境中获取铁离子。铁载体头孢菌素利用这一特性,将头孢菌素骨架与铁载体模拟结构偶联,通过特洛伊木马策略主动穿透细菌外膜,绕过传统头孢菌素依赖的孔蛋白被动扩散途径,从而对孔蛋白缺失或外排泵过表达的耐药菌仍保持抑制活性。

Cefiderocol(头孢地尔,AbMoleM21668是一种肠外铁载体头孢菌素,其分子结构中的儿茶酚基团可结合三价铁离子,形成铁-头孢地尔复合物后通过细菌铁转运系统进入周质空间。进入周质后,Cefiderocol(头孢地尔,AbMoleM21668与青霉素结合蛋白(PBPs)高亲和力结合,对发酵型和非发酵型革兰氏阴性菌的PBP3均具有强效亲和力,对肺炎克雷伯菌的PBP2和铜绿假单胞菌的PBP1也有显著结合能力。CefiderocolS-649266CAS No.1225208-94-5AbMoleM21668对广谱β-内酰胺酶(包括ESBL和金属β-内酰胺酶如NDMVIMIMP)高度稳定,并且其独特摄取机制使其对碳青霉烯耐药革兰氏阴性菌(含产金属β-内酰胺酶株)具有抑制活性。在体外研究中,Cefiderocol对铜绿假单胞菌的MIC₉₀1–4 μg/mL,对产KPCNDM的肠杆菌科MIC₉₀0.12–1 μg/mLCefiderocol的出现为研究细菌铁代谢与抗菌之间的交叉影响提供了重要工具

 

1. Cefiderocol的作用机理:头孢地尔可通过铁铁载体途径进入细菌,同时经孔蛋白实现更高通透效率。此外,头孢地尔对青霉素结合蛋白(PBP)亲和力提升,且不易被外排泵外排,上述特性共同增强了其细菌抑制能力。

二、新型四环素类衍生物

四环素类抗生素通过与细菌30S核糖体亚基结合,阻止氨酰-tRNA进入A位,抑制蛋白质合成。然而,经典四环素面临外排泵(TetA/B)和核糖体保护蛋白(TetM/O)介导的耐药问题。新型四环素衍生物通过结构修饰克服了上述耐药机制,拓展了抗菌谱并增强了对耐药菌的抑制活性。

Eravacycline(依拉环素,AbMoleM22437属于氟环素类,其在四环素母核的C-7位引入氟原子、C-9位引入吡咯烷基乙酰氨基侧链,这些修饰使其不受经典四环素外排泵(tetAtetB编码)和核糖体保护蛋白(tetMtetO编码)的影响。EravacyclineTP-434CAS No.1334714-66-7AbMoleM22437对革兰氏阳性菌(含MRSAVRE)、革兰氏阴性菌(含产ESBL株)及厌氧菌均具有广谱抑制活性,其MIC值较Tigecycline替加环素 GAR-9362–8倍。在体外研究中,Eravacycline对大肠杆菌的MIC₉₀0.25 μg/mL,对肺炎克雷伯菌的MIC₉₀0.5 μg/mL,对耐万古霉素肠球菌(VRE)的MIC₉₀0.06 μg/mLEravacycline(依拉环素,AbMoleM22437为研究细菌的四环素耐药机理以及动物耐药菌感染模型的抑制策略提供了工具。

 

2. Eravacycline的作用机理:通过结合细菌核糖体的30S亚基,抑制蛋白质合成,阻止氨基酰基tRNA结合mRNA-核糖体复合体上的受体位点。

Omadacycline(奥马环素,AbMoleM21492属于氨甲基环素类,其在米诺环素骨架的C-9位引入氨甲基修饰,增强了与30S核糖体亚基的结合亲和力,同时克服了tetA/B外排泵和tetM/O核糖体保护蛋白介导的耐药。Omadacycline对革兰氏阳性菌(含MRSAVRE)、革兰氏阴性菌及非典型病原体(如肺炎支原体、嗜肺军团菌、衣原体)均具有广谱抑制活性。在体外研究中,OmadacyclineCAS No.389139-89-3AbMole对金黄色葡萄球菌(含MRSA)的MIC₉₀0.25–1 μg/mL,对肺炎链球菌为0.06–0.12 μg/mL,对非典型病原体的MIC₉₀0.03–0.12 μg/mL 铜绿假单胞菌OmadacyclinePTK 0796AmadacyclineAbMoleM21492具有天然耐药性,这一特性使其成为研究四环素类外膜穿透机制及铜绿假单胞菌固有耐药机制的对照工具。

 

3. OmadacyclineTetracyclineTigecycline等四环素类抗生素有着相同的作用机理

三、新型拓扑异构酶抑制剂

细菌DNA促旋酶(Gyrase)和拓扑异构酶Topo IV)是维持细菌DNA拓扑结构的关键II型拓扑异构酶,也是氟喹诺酮类抗生素的经典靶点。然而,氟喹诺酮耐药基因(如gyrA/parCQRDR区突变)的广泛传播迫切需要研发新型拓扑异构酶抑制剂。三氮杂苊烯类化合物通过结合细菌的GyraseTopo IVATP酶结构域(而非氟喹诺酮结合的DNA断裂重连结构域),实现了全新的抑制机制。

Gepotidacin(吉泊达星)是一种首创的三氮杂苊烯类细菌II型拓扑异构酶抑制剂。其分子结构中的三氮杂苊烯母核通过π-π堆积与DNA的两个中央碱基对相互作用,碱性胺基团与GyrAAsp90(或ParCAsp86)形成离子键,右侧疏水基团嵌入GyrA/ParC二聚体界面的疏水口袋。GepotidacinCAS No.1075236-89-3AbMoleM25614细菌的GyraseTopo IV具有均衡的双重抑制活性(对大肠杆菌两种酶的IC₅₀均为亚微摩尔级别),且仅诱导单链DNA断裂(而非氟喹诺酮诱导的双链断裂)。这种双重靶向机制意味着需要同时在GyraseTopo IV中发生突变才能产生显著耐药,从而降低了细菌的耐药进化速率。GepotidacinGSK2140944AbMoleM25614对大肠杆菌、肺炎克雷伯菌、奇异变形杆菌、弗氏柠檬酸杆菌、腐生葡萄球菌及粪肠球菌等病原体均具有强效抑制活性,包括对氟喹诺酮和头孢菌素耐药株。在体外研究中,Gepotidacin对大肠杆菌的MIC₉₀0.25–1 μg/mL,对多重耐药淋病奈瑟球菌的MIC₉₀0.06–0.25 μg/mL。淋病奈瑟球针对GepotidacinGSK2140944,吉泊达星AbMoleM25614的耐药主要与ParC D86NGyrA A92T突变相关,为研究拓扑异构酶抑制剂耐药进化及新型抗菌靶点验证提供了重要工具。

 

4. Gepotidacin晶体结构与金黄色葡萄球菌DNA之间的结合示意图

四、碳青霉烯类

碳青霉烯类抗生素具有广泛的抗菌谱,且对多数β-内酰胺酶(包括ESBLAmpC)高度稳定。

Imipenem(亚胺培南)是首个碳青霉烯类化合物,其1β-甲基碳青霉烯结构赋予了对革兰氏阳性菌、阴性菌及厌氧菌的广谱抑制活性。Imipenem动物肾脱氢肽酶-IDHP-I)部分敏感,在动物实验中需与CilastatinMK0791 联用以防止肾脏降解。ImipenemMK0787AbMoleM7845PBP1PBP2PBP4具有高亲和力,在ESBL产生菌的敏感性研究中常用作阳性对照。细菌对ImipenemCAS No.74431-23-5AbMoleM7845的耐药机制包括碳青霉烯酶(KPCNDMOXA-23等)的水解、孔蛋白(OmpK35/36)缺失导致的药物摄入减少,以及外排泵(MexAB-OprM)过表达。

Meropenem(美罗培南,AbMoleM2261也是碳青霉烯类抗生素,它C-1位引入甲基后对DHP-I完全稳定,无需酶抑制剂联用。MeropenemCAS No.96036-03-2AbMole对铜绿假单胞菌的活性优于ImipenemMK0787亚胺培南 ,且对革兰氏阳性菌(含肺炎球菌)保持强效抑制。Meropenem(美罗培南,SM 7338 AbMoleM2261PBP2PBP3具有高亲和力,是研究碳青霉烯耐药机制(如金属β-内酰胺酶NDM/VIM/IMP、外排泵OprM过表达、孔蛋白OprD缺失)及碳青霉烯酶底物谱的常用工具。

 

5. 几种碳青霉烯类抗生素的化学结构

五、恶唑烷酮

恶唑烷酮抗生素通过结合细菌50S核糖体亚基的23S rRNA,阻止70S起始复合物的形成,从而抑制蛋白质合成的起始阶段。这一独特机制使其对多种耐药革兰氏阳性菌(含MRSAVRE)具有抑制活性,且与其他蛋白质合成抑制剂无交叉耐药。

Linezolid(利奈唑胺)是首个恶唑烷酮类化合物,通过与50S核糖体亚基中肽基转移酶中心附近的23S rRNA高亲和力结合,阻止fMet-tRNAP位点的正确结合,从而阻断翻译起始。LinezolidCAS No.165800-03-3AbMoleM1924对革兰氏阳性菌(含MRSAVRE、耐青霉素肺炎链球菌)具有抑制活性,对结核分枝杆菌等分枝杆菌也显示出抑制效果。Linezolid对链球菌具有杀菌活性,而对葡萄球菌和肠球菌主要为抑菌活性在体外研究中,LinezolidPNU-100766利奈唑胺,AbMoleM1924MRSAMIC₉₀1–2 μg/mL,对VRE1–4 μg/mLLinezolid的耐药机制主要包括23S rRNAG2576U点突变(降低核糖体亲和力)和cfr甲基转移酶基因介导的23S rRNA甲基化(同时降低氯霉素、林可霉素和恶唑烷酮的亲和力),为研究核糖体功能及蛋白质合成起始机制提供了独特工具。此外,LinezolidAbMoleM1924作为可逆性单胺氧化酶(MAO)抑制剂,在神经递质代谢研究中也有应用价值。

 

6.恶唑烷酮抗生素Linezolid的核糖体结合位点

范例详解

Front Immunol. 2025 Jul 17;16:1623182.

实验人员在论文中构建胞内 MRSA 持留菌感染的体内外模型,探究中药复方补肺解毒方(BFJD)抗持留 MRSA 的作用机制,发现 BFJD 无直接体外杀菌活性,但可通过激活CD40ROSNFκB信号轴,促进巨噬细胞向 M1 型极化,逆转 MRSA 持留感染所致的促炎基因抑制,提升机体免疫清除能力,降低小鼠肺、肝、肾组织的细菌载量,同时筛选出白术内酯 、芒柄花素两个可靶向结合 CD40 的活性成分;科研人员在实验中AbMoleLinezolid(利奈唑胺,PNU-100766AbMoleM1924作为对照药物,结果显示利奈唑胺体外对 MRSA 具有较强的抑菌活性(MIC=2 μg/mL

 

7. 源自AbMole客户发表的文献: Front Immunol. 2025 Jul 17;16:1623182.

编号

名称

中文名称

CAS

主要研究方向

M21668

Cefiderocol

头孢地尔

1225208-94-5

铁载体头孢,碳青霉烯耐药革兰氏阴性菌

M22437

Eravacycline

依拉环素

1334714-66-7

氟环素,多重耐药菌

M21492

Omadacycline

奥马环素

389139-89-3

氨甲基环素,非典型病原体

M25614

Gepotidacin

吉泊达星

1075236-89-3

三氮杂苊烯,DNA促旋酶/拓扑异构酶

M7845

Imipenem

亚胺培南

74431-23-5

首个碳青霉烯,DHP-I敏感性

M2261

Meropenem

美罗培南

96036-03-2

碳青霉烯,DHP-I稳定

M1924

Linezolid

利奈唑胺

165800-03-3

恶唑烷酮,蛋白质合成起始抑制

*上述所有均为科研试剂,仅供科学研究参考。

参考文献

[1] Ito A, Nishikawa T, Matsumoto S, et al. Siderophore conjugate monocarbams utilizing novel trisubstituted catechol siderophore scaffolds are active against carbapenem-resistant Enterobacteriaceae by evading carbapenemase hydrolysis. Antimicrob Agents Chemother 2016, 60(1), 183-191.

[2] Falagas ME, Vardakas KZ, Kapaskelis A, et al. Resistance of Gram-Negative Bacteria to Eravacycline. Antibiotics 2025, 14(9), 814.

[3] Houghton JL, Biswas D, Chen W, et al. Interactions between Gepotidacin and Escherichia coli Gyrase and Topoisomerase IV: Genetic and Biochemical Evidence for Well-Balanced Dual-Targeting. ACS Infect Dis 2024, 10(6), 2103-2116.

[4] Sun H, Meng X, Li Y, et al. Omadacycline Pharmacokinetics: Characteristics, Contributing Factors, and Clinical Significance. Pharmaceutics 2025, 17(3), 307.

[5] Papp-Wallace KM, Endimiani A, Taracila MA, et al. Carbapenems: past, present, and future. Antimicrob Agents Chemother 2011, 55(11), 4943-4960.

[6] Swaney SM, Aoki H, Ganoza MC, et al. The oxazolidinone linezolid inhibits initiation of protein synthesis in bacteria. Antimicrob Agents Chemother 1998, 42(12), 3251-3255.



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