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引言
猪沙病毒 (PoSaV) 是一种能够引发猪只胃肠炎症状的病毒,广泛分布于全球多国。尽管PoSaV在许多国家都有报道,但至今没有关于越南的相关研究。本研究旨在探讨越南北部养殖猪只中PoSaV的感染情况,并对其基因型进行遗传学分析。发表在Veterinary Sciences 期刊的研究结果显示,越南北部的猪群中PoSaV的感染率较低,但却表现出多种基因型的共循环。
研究目的与方法
1. 样本采集与实验设计
本研究从2022年7月到2023年3月期间,采集了102个来自越南北部不同省市的猪只粪便样本。样本包括来自不同年龄段 (断奶猪、育肥猪和母猪) 且患有腹泻和脱水症状的猪只。这些样本经过聚合酶链式反应 (PCR) 检测,用于确认PoSaV的存在,并通过部分RNA依赖性RNA聚合酶 (RdRp) 基因区域进行序列分析。
2. PoSaV基因检测
在102个样本中,10个样本 (占9.8%) 被检测为PoSaV基因阳性。此外,通过基因序列分析,研究人员进一步确认了这10个病毒株属于不同的基因型。通过对比基因组序列,发现8个样本属于III基因型,2个样本属于VIII基因型。
研究结果
1. PoSaV基因型的检测
在所采集的样本中,PoSaV的感染率最高的省份为Hungyen (13.95%),其次是Hanoi和Haiphong (均为10%)。Thanhhoa省未发现PoSaV阳性样本 (0/6)。根据养殖规模,感染率在小规模养殖场 (<100头) 为5.77%,中等规模养殖场 (100–300头) 为15.00%,而大规模养殖场 (>300头) 为13.33%。
2. PoSaV基因组序列分析
研究人员对10个阳性样本的RdRp基因序列进行了测序。结果显示,这些PoSaV株的核苷酸身份度在61.39%到100%之间。通过与全球其他地区的PoSaV株进行比较,发现越南的病毒株与韩国、委内瑞拉和荷兰的PoSaV株在基因组上有较高的相似性。
3. 分子进化与基因型分类
基因序列分析揭示,越南的10个PoSaV病毒株属于III基因型 (8个株) 和VIII基因型 (2个株)。其中,III基因型进一步分为两个亚群。这些PoSaV株的基因型与来自韩国、荷兰和委内瑞拉的PoSaV病毒株较为相似,且显示出全球范围内PoSaV的广泛传播。
讨论
1. PoSaV的全球传播
PoSaV是一个影响广泛的病毒,已在全球多个国家的猪群中被发现。尽管PoSaV的感染率在越南相对较低,但本研究首次报告了该病毒在越南猪群中的存在,尤其是在断奶和育肥阶段的猪只中。PoSaV的基因型分布表现出较高的遗传多样性,尤其是III和VIII基因型的共循环,这为今后的流行病学研究提供了重要信息。
2. PoSaV的潜在重组
PoSaV的重组是一个已知的现象,尤其是在多基因型共存的环境中。研究发现,越南北部的猪群中III基因型和VIII基因型的共循环,可能为病毒重组提供了条件,进而产生新的PoSaV株。这种现象可能会影响病毒的传播能力和致病性,因此在控制和预防PoSaV的传播时,必须考虑这一点。
3. PoSaV与其他胃肠病毒的共同感染
尽管本研究没有检测到PoSaV与猪流行性腹泻病毒 (PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒 (TGEV) 和猪轮状病毒 (PoRV) 的共感染,但全球其他地区的研究表明,PoSaV常与其他肠道病毒共同感染,尤其是在腹泻猪只中。因此,未来的研究应扩大样本量,检测PoSaV与其他病原体的共感染情况。
结论
本研究首次报告了越南北部猪群中PoSaV的感染情况,并对病毒株进行了基因型的分类。研究发现,PoSaV在该地区猪群中的流行表现为III基因型和VIII基因型的共循环,这为今后PoSaV的传播动态和防控策略的制定提供了重要数据。未来的研究应关注病毒的重组事件和共感染的影响,以有效控制PoSaV在越南及其他地区的传播。
Veterinary Sciences 期刊介绍
主编:Patrick Butaye, Ghent University, Belgium; City University of Hong Kong, China
发表与兽医科学领域相关的原创研究文章、评论、通讯和简短说明,主题包括动物疾病、紊乱和损伤的预防、诊断和治疗。
2024 Impact Factor: 2.3
2024 CiteScore: 3.5
Time to First Decision: 17.8 Days
Acceptance to Publication: 2.6 Days
期刊主页:https://www.mdpi.com/journal/vetsci

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