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Nature Communications:MADS蛋白intervening结构域的功能分析

已有 3516 次阅读 2021-8-8 09:56 |个人分类:每日摘要|系统分类:论文交流

The intervening domain is required for DNA-binding and functional identity of plant MADS transcription factors

第一作者Xuelei Lai

第一单位法国格勒诺布尔-阿尔卑斯大学

第一单位Chloe Zubieta


 Abstract 


背景回顾The MADS transcription factors (TF) are an ancient eukaryotic protein family. In plants, the family is divided into two main lineages. 


主要发现:Here, we demonstrate that DNA binding in both lineages absolutely requires a short amino acid sequence C-terminal to the MADS domain (M domain) called the Intervening domain (I domain) that was previously defined only in type II lineage MADS. 


结果1-结构分析:Structural elucidation of the MI domains from the floral regulator, SEPALLATA3 (SEP3), shows a conserved fold with the I domain acting to stabilise the M domain.


结果2-结构域互换:Using the floral organ identity MADS TFs, SEP3, APETALA1 (AP1) and AGAMOUS (AG), domain swapping demonstrate that the I domain alters genome-wide DNA-binding specificity and dimerisation specificity.


结果3-功能互补试验:Introducing AG carrying the I domain of AP1 in the Arabidopsis ap1 mutant resulted in strong complementation and restoration of first and second whorl organs. 


结论:Taken together, these data demonstrate that the I domain acts as an integral part of the DNA-binding domain and significantly contributes to the functional identity of the MADS TF.



 摘 要 


MADS转录因子是一类古老的真核生物蛋白家族。在植物中,该家族的基因主要分为两个支系。本文中,作者发现这两个支系的MADS蛋白发挥功能都需要MADS(M)结构域C端的一段短的氨基酸序列,称之为Intervening(I)结构域,之前的研究认为该结构域仅在II类MADS蛋白支系中存在。对于开花调控蛋白SEP3的MI结构域的结构解析显示,MI结构域存在一个比较保守的折叠方式,其中I结构域起到稳定M结构域的作用。利用花器官决定基因SEP3、AP1和AG,作者通过互换结构域试验,发现I结构域改变了目的蛋白的全基因组上结构DNA的特异性和二聚化的特异性。以拟南芥的ap1突变体为背景,引入具有AP1蛋白I结构域的AG基因能够很好地互补并拯救ap1突变体花第一轮和第二轮器官的缺陷。综上,本文的研究结果揭示了I结构域作为MADS转录因子的DNA结合结构域组成部分发挥作用,并且能够显著作用于MADS转录因子的生物学功能。


doi:  https://doi.org/10.1038/s41467-021-24978-w


Journal: Nature Communications

Published date: August 06, 2021



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