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高同源SNP分型-多重长片段PCR打断建库技术

已有 271 次阅读 2025-11-25 16:11 |系统分类:科研笔记

同源区域中的单核苷酸多态性在遗传学研究中发挥着至关重要的作用。然而,由于基因组中存在重复序列,对这些SNP进行基因分型颇具挑战性,需要采用特定的方法。

翼和生物技术团队开发的多重长片段PCR打断建库技术可以高效且准确地进行SNP基因分型而免受高同源区段影响(Lu, M., Li, J., Sun, X., Zhao, D., Zong, H., Tang, C., Li, K., Zhou, Y., & Xiao, J. (2024). Genotyping single nucleotide polymorphisms in homologous regions using multiplex kb level amplicon capture sequencing. Molecular genetics and genomics : MGG, 299 1, 99 .)。这是一种新型的中通量技术,“多重”——在一个反应管中,一次性捕获10个左右特异性片段。“长片段”——能扩增出5k-10k片段,跨过高同源区,读到目的片段核苷酸的完整序列。捕获之后可以通过二代高通量测序大幅度提升获得高同源区段SNP精准信息的能力。此外,这也代表多重长片段技术所需样本消耗更少,更节约成本。

图片1.png 

高同源区段SNP技术流程图

 

高同源区段SNP应用多重长PCR捕获建库技术,完美结合了长PCR和多重PCR,吸收了两种方法的优点,首次挑战并建立了一种新的靶向捕获建库二代测序的方案具有5大优势:长PCR跨同源区捕获,大区间低成本覆盖,少量样本经济性,复杂变异检测,实验周期明显缩短



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