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LDR-SNP分型与Hi-SNP分型,双平台解决方案

已有 463 次阅读 2025-9-28 13:23 |个人分类:SNP|系统分类:博客资讯

SNP分型实验中,选择正确的技术平台是成功的一半。面对琳琅满目的技术方法,为何我们最终聚焦于PCR-LDR和基于二代测序的Hi-SNP这两大平台,并为您提供专项服务?答案的核心在于:摒弃万能的幻想,追求最优的匹配。

一、中低通量研究的利器:PCR-LDR SNP分型服务

核心原理:多重PCR扩增→连接酶区分SNP(探针仅当完全匹配时连接)→毛细管电泳

适用场景:项目需要检测的SNP位点较少,样本量在几十例。典型应用包括:药物基因组学核心位点验证、特定通路关键基因多态性筛查、临床诊断标志物确认等。

翼和技术优势:

准确性自主知识产权的多重PCR为基础,依靠DNA连接酶对碱基错配的敏感性,使其LDR分型准确性远超常规PCR方法,结果可靠,可用于发表高水平论文和临床报告。

极高的灵活性:可根据需求灵活设计引物,扩增目标片段,进行检测。当您的研究焦点明确时,无需为整个基因组付费。单次操作可处理几个到上百个样本(全自动测序仪一般有8164896根毛细管,自动上样)单次实验可检测多达20位点的基因型

成本效益最大化:对于中低通量项目,该平台在试剂和设备上的投入远低于高通量测序,为您节约宝贵的科研经费。

二、高通量研究的引擎:基于二代测序的Hi-SNP分型服务

核心原理:对捕获区域进行深度测序,比对识别SNP

适用场景:项目规模宏大,需要检测的SNP位点较多,样本量。典型应用包括:全基因组关联分析、群体遗传学研究、多基因风险评分模型构建等。

翼和技术优势:

通量SNP位点30-500个之间,数百数千样本推荐使用一次实验即可获得海量数据,这是任何传统技术都无法比拟的规模优势。平均测序深度1000

一举多得数据产出:不仅能够对已知的SNP进行分型,还能SNP位点以及周围序列进行测序在分析中发现新的、稀有的遗传变异,极大拓展了研究的深度和广度。

规模化下的低单点成本:当位点和样本数量足够大时,每个数据点的成本极具竞争力且保持高检出率和高准确率

三、为何我们专注于此双平台战略?——对其他方法的专业取舍

我们之所以集中资源优化这两个平台,是基于对技术优劣和客户需求的深刻理解。以下是我们不将其他方法作为主力服务平台的核心理由:

等位基因特异性PCR利用PCR引物3末端的特异性。通量极低,假阳性率高标准化难。因为实验设计简单、成本低,适合实验室内部验证个别位点,但难以实现多位点、多样本的高效、标准化检测,不适合作为商业化服务一些低频位点快速筛查可以使用。

PCR-RFLP利用限制性内切酶对特定序列的切割能力流程繁琐,通量低自动化程度低,假阳性率高。依赖酶切位点。需要凝胶电泳,步骤多、耗时长,易引入人为误差,无法满足现代科研对效率和规模的要求只有预算极其有限,且对灵敏度要求不高情况下,可以作为最初步的、非结论性的筛查工具

TaqMan探针法基于PCR的荧光探针水解与荧光信号检测成本与通量的尴尬区在性价比和灵活性上被LDRHi-SNP双向夹击优势是操作简单、单样本单点位快速检测,但通量极低,无法同时检测多点位。适用于单点位验证

基因芯片将探针固定芯片上,捕获样本DNA灵活性差,信息量固定。芯片位点是预先设定的,无法自由改变。其检测范围限于已知变异,无法发现新位点。对于非标准定制需求,芯片成本高昂通常需要专业公司服务通常用于遗传病筛查等方向,Hi-SNP则在通量和灵活性上全面超越。

总结

 

如果您的研究是精准狙击:目标明确,SNP位点和样本量较少,请选择我们的PCR-LDR服务平台进行精准、可靠的验证。它为您提供了最佳的成本控制、卓越的准确性和快速的交付周期。

如果您的研究是全景扫描:需要在大规模群体中筛选海量的遗传标记,或是探索未知,请选择我们的Hi-SNPNGS)服务平台。它将为您打开一扇通往大数据研究的大门。

 



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