对于Linux初级用户来说，采用编译源码的方式安装软件并非易事。特别是一些科研软件，一方面自述文档极其简略，另一方面用户少，找不到合适的攻略（ps：之前最详细的一份攻略中，老外也忍不住吐槽LEDAPS文档太粗糙http://karthur.org/2015/ledaps-installation-ubuntu.html），一些配置错误可能折腾很久。最近在Fedora23下安装LEDAPSv1.3.0花了近4天时间，走了很多弯路。有必要记录下详细步骤，分享给需要的人。

1. LEDAPS简介

该系统本身就是面向批量处理而设计，只需要输入解压好的Landsat影像，就会输出校正后的地表反射率。

LEDAPS（The LandsatEcosystem Disturbance Adaptive Processing System）是NASA的一个研究大陆区域森林扰动等的项目。该系统利用为MODIS开发的大气校正方法对Landsat进行处理。方法采用的是6S模型，其输入需要水汽和臭氧浓度等辅助参数。这些参数利用传统方法获取成本较高，LEDAPS通过NCEP（National Centers for Environmental Prediction，美国国家环境预报中心）水汽数据，TOMS（Total Ozone Mapping Spectrometer，臭氧总量探测仪）臭氧数据产品作为参数，使得模型有了标准化的大气参数。对于精度，研究显示，在全球范围，使用LEDAPS估算的Landsat地表反射率数据同MODIS地表反射率产品具有高度的一致性，其均方根误差（Root Mean–Squared Deviation, RMSD）介于1.3-2.8。

这里采用的LEDAPS系统为1.30版，代码下载地址为（http://code.google.com/p/ledaps/）。安装包分两部分：

（1）ledaps.tar.gz即系统源代码；

（2）ledapsAnc.1980-2010.tar.gz等，即各个年份的辅助参数。

2. Linux下安装应用简介

熟悉Linux的人请忽略本节。

通常，Linux的安装包有两类：

（1）打包的可执行程序：

优点是方便，缺点是不能灵活定制。

类似windows下的安装包，如：rpm包（后缀.rpm），是RedhatLinux(Fedora)提供的一种包封装格式。dpkg包（后缀. deb），如software-1.2.3-1.deb。它是Debain Linux(Ubuntu, Linux Mint）提供的一种包封装格式。

（2）打包的源代码

优缺点与前一类相反

为tar包，通常压缩完后缀为.tar.gz、.tar.Z等，通过“tar zxvf文件名”来解压，然后分三步安装：

#注意，部分时候，安装前还需要配置一些其他信息

1）执行“./configure --prefix=… --with-…=…”为编译和链接设置参数；其中，prefix用来指定软件将要安装的位置，with指定依赖包的安装目录。

2）执行“make”编译源代码

3）执行“make install”安装软件

#安装完还可以用“makecheck”或“make test”测试安装结果，如果源码提供了测试。

Linux新手还可以参考这篇博文：

http://www.cnblogs.com/jyginger/archive/2010/07/25/1784599.html

3. LEDAPS各种依赖包的配置与安装

注意：Ledaps安装的难点主要在这部分

（1）各种依赖包的准备

Ledaps的readme只说系统本身依赖的包有：HDF-EOSGCTP, HDF4, HDF-EOS2, TIFF, GeoTIFF。它没说而又值得注意的是：

1）这些被依赖的包还依赖一些其他的包：所以还要加上JPEG, SZIP, ZLIB, PROJ4这四个包（依赖关系参见后面的安装配置）。

2）HDF-EOS GCTP和HDF-EOS2其实都在HDF-EOS包里面。而HDF和HDF-EOS名字相近，是两个独立包（HDF-EOS依赖HDF）。

3）需要特别注意各个包的版本号，应按照从后往前的顺序，看需要什么版本依赖包去对应下载，不是越新越好。例如，hdf-4.2.10依赖jpeg-6b，jpeg-6b里面坑较多，安装麻烦。尽管jpeg-9a的bug少容易配置，但会导致hdf编译通不过“make check”！

（2）安装配置

以下是各安装包的配置（./configure）方法，一些额外配置（填坑记录！）会加#号说明。

先从最简单的zlib开始，斜体为通用步骤，每个包安装都需要，不再累述。

1) zlib

        cd /usr/local

        sudo mkdir zlib

        sudo chown USERNAME zlib                    注意，USERNAME是你的linux账户名哦

        tar zxvf zlib-1.2.8.tar.gz

./configure --prefix=/usr/local/zlib

make

make install

make check

make clean

安装成功后，会看到/usr/local/zlib 目录下多了inlucde, bin,lib, man几个目录

接下来重复的步骤不再累述，只介绍最关键的configure和特殊情况

2) szip

      ./configure --prefix=/usr/local/szip

3) jpeg-6b

    #坑1. jpeg-6b包居然需要自己建目录，否则安装失败。所以，记得在安装目录下输入sudo mkdir include bin lib man man/man1

./configure --prefix=/usr/local/jpeg --enable-shared=yes --enable-static=yes

#坑2. 有时还会遇到错误，如Fedora23下configure失败，提示”checkinghost system type… Invalid configuration ‘x86_64-unknown-linux-gnu’: machine‘x86_64-unknown’ not recongnized”。此时，需要将libtool这个包（没有的话先安装）目录（libtool/build-aux/）下的configure.guess和configure.sub拷贝到jepg源文件目录下，然后configure。详情还可以参考 http://blog.csdn.net/php_boy/article/details/7382998

4) tiff

  ./configure --prefix=/usr/local/tiff --with-jpeg-include-dir=/usr/local/jpeg/include --with-jpeg-lib-dir=/usr/local/jpeg/lib --enable-shared=yes --enable-static=yes --with-zlib-include-dir=/usr/local/zlib/include --with-zlib-lib-dir=/usr/local/zlib/lib

   #坑3. 大多数包只需要指定一个包的根目录，唯有tiff需要单独指定其include和lib。所以每次安装前记得查看安装包中的configure文件，了解--with后面的格式。

5) proj4:

  ./configure --prefix=/usr/local/proj4 --enable-shared=yes --enable-static=yes

6) libgeotiff:

./configure --prefix=/usr/local/geotiff --with-libtiff=/usr/local/tiff --with-proj=/usr/local/proj4 --with-zlib=/usr/local/zlib

#坑4. 我用的libgeotiff1.3.0，一旦加上--with-jpeg=/usr/local/jpeg就会configure失败。

7) hdf4:

  ./configure --prefix=/usr/local/hdf --enable-shared=yes --enable-static=yes --with-szlib=/usr/local/szip --with-zlib=/usr/local/zlib --with-jpeg=/usr/local/jpeg --disable-fortran

   #坑5. 一定记得--disable-fortran

8) hdfeos:

#坑6. 尽管通过--with指定了szip和zlib的目录，但安装包就是找不到，解决办法是configure前输入export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/szip:/usr/local/zlib

./configure CC=/usr/local/hdf/bin/h4cc --enable-install-include --prefix=/usr/local/hdfeos --with-szlib=/usr/local/szip --with-zlib=/usr/local/zlib --with-hdf4=/usr/local/hdf --with-jpeg=/usr/local/jpeg

   #坑7.如果通过--prefix指定了安装目录，则HDF-EOSGCTP和HDF-EOS2都会在该目录下的include和lib目录下。如果没有指定，则会分别安装到源码目录下的gctp和hdfeos2目录中。

如果顺利越过7个坑，安全的装上8个包，恭喜，可以安装ledaps了。

4. LEDAPS安装

相对上面容易多了，分三步：

（1）解压参数集

将ledapsAnc.1980-2010.tar.gz文件解压到"…/LedapsAnc"目录，并在接下来将该目录赋予ANC_PATH变量。

（2）设置路径

建立一个env.sh文件，添加各个包的路径：

export HDFEOS_GCTPINC="/usr/local/hdfeos/include"

export HDFEOS_GCTPLIB="/usr/local/hdfeos/lib"

export TIFFINC="/usr/local/tiff/include"

export TIFFLIB="/usr/local/tiff/lib"

export GEOTIFF_INC="/usr/local/geotiff/include"

export GEOTIFF_LIB="/usr/local/geotiff/lib"

export HDFINC="/usr/local/hdf/include"

export HDFLIB="/usr/local/hdf/lib"

export HDFEOS_INC="/usr/local/hdfeos/include"

export HDFEOS_LIB="/usr/local/hdfeos/lib"

export BIN="… /ledapsSrc/bin"

export ANC_PATH="…/LedapsAnc"

export PATH=$PATH:"…/ledapsSrc/bin"

然后运行source env.sh。当然，更好的方式是，将这些内容添加到/etc/profile里面，然后注销。这样每次启动都自动保存这些路径。

（3）安装

进入… /ledapsSrc/src目录，输入make和make install就Ok了（根据本人目前的这些设置，lndsrbm仍然无法编译成功，不过不影响得到sr数据，有人知道如何解决还请帮忙指出）。

编译成功后会在… /ledapsSrc/bin下添加lndpm,lndapp, lndcal, lndsr, sixsV1.0B共5个可执行文件。

5. 使用

其中，lndpm是预处理，lndcal是将DN值转化为TOA，lndsr会调用sixsV1.0B，用来计算地表反射率。

实际使用时，直接执行：

csh do_ledaps.csh LT51240462005245BJC00_MTL.txt                

*示例文件名，假设do_ledaps.csh和影像在同一目录

等待4分半就会得到hdf格式的sr数据了（i7-47903.9GHZ的cpu，4g内存）。

#坑8. 注意，待处理的Landsat影像前一定不能有目录，否则运行失败。即：

# csh do_ledaps.csh …/somedir/LT51240462005245BJC00_MTL.txt                失败

# csh …/somedir/do_ledaps.cshLT51240462005245BJC00_MTL.txt                 成功

如果还有其他问题，请仔细检查《4. LEDAPS安装》是否正确。

6. 版本和下载链接

jpegsrc.v6b           http://sourceforge.net/projects/libjpeg/files/libjpeg/

zlib-1.2.8            http://zlib.net/

szip-2.1              http://www.hdfgroup.org/HDF5/release/obtain5.html

tiff-4.0.6            http://www.linuxfromscratch.org/blfs/view/svn/general/libtiff.html

proj-4.9.2            https://github.com/OSGeo/proj.4/wiki

libgeotiff-1.3.0      http://trac.osgeo.org/geotiff/

hdf-4.2.11            http://www.hdfgroup.org/products/hdf4/

HDF-EOS2.19v1.00      http://hdfeos.org/software/library.php#HDF-EOS2

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广州地理研究所 姜浩 原创

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