1956年是陈民藩从事中医肛肠工作的第一年。初出茅庐的他接诊了一名因血便、疼痛等症状在其他医院当作痔疮治疗却一直不见好转的患者。通过询问病史、仔细的指诊检查，陈民藩发现患者肛门深处有一个占位病变，他赶快请来更有经验的老师再检查，经过反复检查，最后确诊为直肠癌。患者随后到上海的大医院做了手术，切下有半个乒乓球大小的肿瘤。

发现了其他医院外科主任漏诊的直肠癌，年轻的陈民藩更加坚定了要用所学知识为患者解决病痛的决心。他从研究规范枯痔钉砒霜的安全用量着手，让枯痔钉不再是“以毒攻毒”。

在中医学上，“痔疮脱水干枯坏死”叫枯痔。枯痔疗法在我国有悠久的历史，其中应用枯痔散治疗最早见于南宋，之后演变发展成枯痔钉疗法。20世纪五十年代前后，枯痔钉疗法盛行，但传统的枯痔钉含砒霜、明矾等药物，把握不好分寸会发生砒霜中毒。

如何减少传统枯痔钉“以毒攻毒”带来的毒副作用？陈民藩开展了一系列的科学研究和临床攻关。他先将含砒量降低，通过3000多例临床数据，以及持续的实验研究，找到了含砒枯痔钉合适的用法用量，得到同道的认可，写进含砒枯痔钉的诊疗规范中。六十年代初，他又研究出了去掉砒霜、留下明矾的“无砒枯痔疗法”。

“我们发现，使用无砒的枯痔钉后，患者肝肾功能不受影响，但有些患者会发烧，我们就想如何减少感染，后来尝试着用注射疗法，调配出合适的枯痔液，做到无菌操作，解决了发烧、血尿的问题。”在不断的研究中枯痔液诞生了。

1978年，陈民藩主持的“枯痔疗法”研究揽获全国科学大会奖、福建省科技成果奖，也因此确立了福建肛肠专科在全国的影响力，福建省更是被誉为“枯痔钉的故乡”。

在痔疮治疗中，陈民藩带领团队不断探索。挂线疗法是传统中医疗法，是用医用丝线、橡皮筋等缠扎患病组织，利用“挂线”的紧箍力，使局部组织坏死。挂线疗法多应用于高位肛瘘、深部脓肿的治疗。陈民藩认为挂线疗法还有引流、止血、标志物等作用，他将挂线疗法进一步应用到肛裂并肛门狭窄、耻骨直肠肌肥厚、痔术后肛门直肠狭窄等疑难疾病的治疗，并加以演化，形成了“多挂线术式”“切挂留皮桥术式”“婴幼儿肛瘘挂线术式”等手术模式，临床效果显著。

同时，他还重视中医药在肛肠学科的特色作用，运用“酸涩收敛”理论研制了紫白膏、消炎生肌膏、消痔洗剂、黄白胶囊、黄术胶囊等一批富有专科特色的中药内服外用制剂，应用于不同疾病或同一疾病不同阶段，有其独特疗效，在福建省内及东南亚地区广泛应用。

陈民藩不仅关注药物研发，还重视对治疗器具的创新。早年科室缺少实用的肛肠手术器具和换药器具，陈民藩带领团队研究设计出一系列适合肛肠手术和换药的专科工具，如探针、镰刀探针、调药勺、引导针等。

几十年如一日的临床工作，陈民藩勤求古训、博采众长，应用和发扬中医学天人合一、辨证论治的学术思想，结合福建地域、季节特点，肛肠疾病病因和位属特征，逐步提出并形成了“湿热论治、以通为用、内外并治、存体寡损、形神兼顾”的肛肠病诊疗和康复思想，建立“陈民藩中西医结合诊疗肛肠病模式”，丰富提升了中医肛肠学科的防治水平，逐步形成闽派中医肛肠的学术特色。