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关于排序图标识的虚化代码

已有 3661 次阅读 2018-10-13 21:55 |个人分类:RDA|系统分类:科研笔记| 排序图背景虚化

 #有时候排序图的中物种或样方过多,造成标识重叠的情况,可以用vegan包中的orditorp将标识虚化


## A cluttered ordination plot :

library(vegan)

data(BCI)

mod <- cca(BCI)

plot(mod, dis="sp", type="t")

# Now with orditorp and abbreviated species names

cnam <- make.cepnames(names(BCI))

plot(mod, dis="sp", type="n")

stems <- colSums(BCI)

orditorp(mod, "sp", label = cnam, priority=stems, pch="+", pcol="grey")





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