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NMDS的是否有解释率?

已有 11122 次阅读 2018-11-13 22:21 |个人分类:RDA|系统分类:科研笔记| NMDS的解释量

   最近老有人问NMDS是否有排序轴是否有解释率?好像有些文章,特别是SBB的文章经常会有文章提供NMDS前几轴解释量(%),根据我的理解,NMDS是非参数的方法,不应该有解释量,不知道他们这些NMDS的解释率是怎么算出来的?我估计是用主坐标分析(PCoA)的解释量来作为NMDS的解释量,但这种张冠李戴的做法可能是不合适的。

Legendre & Legendre 2012 (Numercial Ecology 第513页描述:

 Contrary to PCA, PCoA, or CA, which are eigenvector-based methods, nMDS calculations do not maximize the variability associated with individual axes of the ordination



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1 郭新磊

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