chen7qi的个人博客分享 http://blog.sciencenet.cn/u/chen7qi

博文

ChIP-seq基本分析流程

已有 4445 次阅读 2020-2-24 22:45 |系统分类:科研笔记

前年在中科院做培训时,整理了一套ChIP-seq分析流程,截选实战部分,略作修改,分享出来,希望大家指正。

那次培训内容比较杂,还有关于TCGA、ICGC、ProteinAtlas等数据库的使用, 前面已经分享过,链接如下:

下面步入正题,这套流程从ChIP-实验、测序注意事项、测序深度,到分析整体流程,再到每一步如序列比对,富集效率评估、热图、峰图可视化,deeptools2使用、peak calling和motif分析等。





重磅综述:三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程 (原理、代码和评述)

Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这

ggplot2高效实用指南 (可视化脚本、工具、套路、配色)




https://blog.sciencenet.cn/blog-118204-1220238.html

上一篇:冻存样品对单细胞测序影响大吗?
下一篇:重磅综述:三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程 (原理、代码和评述)
收藏 IP: 114.252.251.*| 热度|

1 孟佳

该博文允许注册用户评论 请点击登录 评论 (0 个评论)

数据加载中...
扫一扫,分享此博文

Archiver|手机版|科学网 ( 京ICP备07017567号-12 )

GMT+8, 2024-11-30 09:42

Powered by ScienceNet.cn

Copyright © 2007- 中国科学报社

返回顶部