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从网络药理学到 能力药理学
熊江辉 2020-12-17 16:48
从网络药理学到能力药理学 熊江辉 网络药理学从系统生物学和生物网络平衡的角度阐释疾病的发生发展过程、从改善或恢复生物网络平衡的整体观角度认识药物与机体的相互作用并指导新药发现。随着网络药理学的兴起，其整体性、系统性的特点与中医药整体观、辩证论治原则一致，目前已被 ...
个人分类: 能力药理学|4604 次阅读|没有评论
中药体系的稳健性思考
熊江辉 2020-12-17 16:02
中药体系的稳健性 熊江辉 1 问题 “全国十省区417批鱼腥草挥发油共检出2431个成分，且每批都在变，但疗效都有抗菌消炎作用，用现代的药理学怎么研究？“ “变中有不变吧？” “大约5个成分，每批都有，但去掉这个成分也有同样作用” （贺教授） 2 基本假设 基石假设：药材的成分与功效是其适 ...
个人分类: 能力药理学|1700 次阅读|没有评论
一种抗感染性疾病药物的启发式发现方法及其在治疗新型冠状病毒肺炎药物发现中的应用初探
熊江辉 2020-9-27 09:22
摘要 目的 建立一种抗感染性疾病药物的启发式发现方法（aCODE方法），以用于抗感染性疾病药物研发。 方法 选择美国食品药品监督管理局（FDA）批准药物数量≥40个的5种感染性疾病（艾滋病、流行性感冒、副黏液病毒感染、细菌性感染和百日咳），每种疾病设实验组和2个阴性对照组（A和B），实验组 ...
个人分类: 网络药理学|1928 次阅读|没有评论
也谈AI医疗乱象，如何破？以人工智能癌症诊断系统为例
热度 2 熊江辉 2017-8-17 22:29
今年6月底的《新英格兰》刊出了一篇观点文章《机器学习和医学预测--远超过高期望的峰值》，文章的批判方法算是很给深度学习这个新工具留面子了。参考这篇文章： 业内人的“针砭时弊”：AI医疗界的3大乱象以及如何评价医学人工智能的成果 ？ 文中提及“ 回观国内市场，这些不靠谱、不合医学逻 ...
个人分类: 人工智能|7214 次阅读|3 个评论 热度 2
数据再定位(data repurposing)：生物医学大数据的新武器
熊江辉 2015-7-29 15:15
一直认为，大数据的一个优势就是将原本分隔各处的数据重新组合，产生价值。读NIH一个新项目指南，他们强调了“数据再定位”(Data Repurposing）的概念及其价值： “数据再定位”(Data Repurposing）是指在生物医学研究中，使用原本不为此类研究目的而创建的数据应用。这可能包括挖掘下列数据的生物医学应用： ...
个人分类: 大数据|4723 次阅读|没有评论
DNA甲基化与未来健康场景
熊江辉 2015-6-3 17:56
个人分类: DNA甲基化|5769 次阅读|没有评论
DnaMe -- 环境DNA甲基化数据库
熊江辉 2015-5-23 22:22
环境暴露可以改变基因的表观遗传状态，如 DNA 甲基化的 改变 。 基因的表 观 遗传学变化是链接环境因素与人体健康的一个重要纽带，可以反映人体受环境因素的影响，以及潜在的健康风险。为了系统了解环境因素的表观遗传学效应，我们建立了“环境 DNA 甲基化 数据库”（ Database of DNA Methylation M ...
5743 次阅读|没有评论
表观遗传流行病学队列研究的方法学：还很原始
熊江辉 2014-12-25 20:53
刚读了一篇综述： The role of longitudinal cohort studies in epigenetic epidemiology: challenges and opportunities 其中专门讲到了DNA甲基化纵向队列研究的方法学现在还处于原始探索阶段，原因当然是-现在还没有像样的时间序列数据（大多已经发表的只有1-2个时间点）。 看样子只有有了超过 ...
个人分类: Longi Data|3859 次阅读|没有评论
吐口水看脑病？唾液vs血液，哪个更能反映精神病患脑部特征？
熊江辉 2014-12-25 18:26
2015新发表的文献： DNA extracted from saliva for methylation studies of psychiatric traits: Evidence tissue specificity and relatedness to brain. 主要结论： 1. 通过DNA甲基化信息，可以用唾液采集来研究精神疾病； 2. 唾液DNA甲基化比血液variance更大 There was more variability in CpG sites from s ...
个人分类: Longi Data|3352 次阅读|没有评论
基于表观遗传学的纵向队列研究：奢侈但是大有可为？
熊江辉 2014-12-25 12:35
最近正在梳理基于表观遗传学的健康跟踪试验，发现与之相近的是一种叫longitudinal epigenetic studies的实验，基于表观遗传信息的此类研究还很少。 这个课件总结的情况中，目前还只有2个时间点的数据，当然其时间跨度比较长。这类研究的一个难点当然是队列的建立，在所 ...
个人分类: Longi Data|3818 次阅读|没有评论
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