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SNP genetic map for scarffold assembly
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遗传连锁图谱(genetic linkage map)指以分子标记为主体构成的染色体线状图，它表示不同分子标记在染色体上的相对位置或排列情况。
传统的构建遗传图谱的分子标记主要是SSR、RFLP、AFLP等，随着高通量测序技术的发展，SNP的发掘已经非常容易，因此应用SNP构建 遗传图谱也就随之诞生。但目前应用SNP图谱辅助scarffold组装成染色体还相对比较少见。由于SNP的高密度性，也意味着用于组装染色体同样具有优势。
例如：Hyten等(2010)通过重测序和芯片技术分析了444株大豆(Glycine soja)的RIL群体及其亲本，找到了1,790个SNPs，用这些SNPs构建的图谱能够将高达97%的scaffolds定位回染色体。
Hyten DL, et al. High-throughput SNP discovery through deep resequencing of a reduced representation library to anchor and orient scaffolds in the soybean whole genome sequence. BMC genomics, 2010, 11:38.
https://blog.sciencenet.cn/blog-491809-386396.html
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